Protein–RNA interactions for Protein: P35998

PSMC2, 26S proteasome regulatory subunit 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC2P35998 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSMC2P35998 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMC2P35998 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMC2P35998 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMC2P35998 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMC2P35998 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMC2P35998 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMC2P35998 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMC2P35998 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMC2P35998 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMC2P35998 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMC2P35998 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMC2P35998 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMC2P35998 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSMC2P35998 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSMC2P35998 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSMC2P35998 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSMC2P35998 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSMC2P35998 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSMC2P35998 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSMC2P35998 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSMC2P35998 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSMC2P35998 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PSMC2P35998 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSMC2P35998 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PSMC2P35998 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSMC2P35998 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSMC2P35998 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMC2P35998 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMC2P35998 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMC2P35998 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PSMC2P35998 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMC2P35998 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMC2P35998 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMC2P35998 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMC2P35998 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMC2P35998 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMC2P35998 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMC2P35998 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMC2P35998 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMC2P35998 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMC2P35998 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSMC2P35998 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSMC2P35998 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMC2P35998 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMC2P35998 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMC2P35998 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMC2P35998 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMC2P35998 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMC2P35998 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMC2P35998 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMC2P35998 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMC2P35998 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMC2P35998 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSMC2P35998 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PSMC2P35998 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSMC2P35998 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSMC2P35998 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMC2P35998 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMC2P35998 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMC2P35998 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMC2P35998 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMC2P35998 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMC2P35998 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMC2P35998 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMC2P35998 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMC2P35998 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMC2P35998 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMC2P35998 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSMC2P35998 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PSMC2P35998 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PSMC2P35998 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PSMC2P35998 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PSMC2P35998 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PSMC2P35998 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PSMC2P35998 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PSMC2P35998 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PSMC2P35998 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PSMC2P35998 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PSMC2P35998 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PSMC2P35998 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PSMC2P35998 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PSMC2P35998 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PSMC2P35998 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PSMC2P35998 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PSMC2P35998 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PSMC2P35998 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PSMC2P35998 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PSMC2P35998 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PSMC2P35998 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PSMC2P35998 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSMC2P35998 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSMC2P35998 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PSMC2P35998 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMC2P35998 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMC2P35998 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMC2P35998 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMC2P35998 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMC2P35998 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PSMC2P35998 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms