Protein–RNA interactions for Protein: P35625

TIMP3, Metalloproteinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP3P35625 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMP3P35625 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMP3P35625 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMP3P35625 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMP3P35625 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMP3P35625 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMP3P35625 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMP3P35625 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMP3P35625 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMP3P35625 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMP3P35625 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMP3P35625 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMP3P35625 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMP3P35625 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMP3P35625 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TIMP3P35625 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMP3P35625 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMP3P35625 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMP3P35625 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMP3P35625 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMP3P35625 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMP3P35625 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMP3P35625 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMP3P35625 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMP3P35625 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMP3P35625 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMP3P35625 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMP3P35625 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMP3P35625 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMP3P35625 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMP3P35625 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMP3P35625 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMP3P35625 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMP3P35625 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TIMP3P35625 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMP3P35625 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMP3P35625 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMP3P35625 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMP3P35625 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMP3P35625 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMP3P35625 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMP3P35625 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMP3P35625 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMP3P35625 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIMP3P35625 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIMP3P35625 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIMP3P35625 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMP3P35625 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMP3P35625 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMP3P35625 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMP3P35625 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMP3P35625 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMP3P35625 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMP3P35625 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMP3P35625 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMP3P35625 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMP3P35625 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMP3P35625 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMP3P35625 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMP3P35625 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMP3P35625 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMP3P35625 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMP3P35625 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMP3P35625 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMP3P35625 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMP3P35625 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMP3P35625 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMP3P35625 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMP3P35625 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMP3P35625 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMP3P35625 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMP3P35625 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMP3P35625 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMP3P35625 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMP3P35625 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMP3P35625 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMP3P35625 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMP3P35625 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMP3P35625 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMP3P35625 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMP3P35625 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMP3P35625 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMP3P35625 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMP3P35625 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMP3P35625 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMP3P35625 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMP3P35625 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMP3P35625 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMP3P35625 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMP3P35625 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMP3P35625 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMP3P35625 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMP3P35625 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMP3P35625 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMP3P35625 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMP3P35625 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMP3P35625 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMP3P35625 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMP3P35625 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMP3P35625 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms