Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LSP1P33241 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LSP1P33241 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LSP1P33241 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LSP1P33241 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LSP1P33241 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LSP1P33241 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LSP1P33241 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LSP1P33241 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LSP1P33241 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LSP1P33241 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LSP1P33241 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LSP1P33241 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LSP1P33241 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LSP1P33241 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LSP1P33241 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LSP1P33241 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LSP1P33241 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LSP1P33241 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LSP1P33241 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LSP1P33241 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LSP1P33241 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LSP1P33241 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LSP1P33241 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LSP1P33241 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LSP1P33241 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LSP1P33241 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LSP1P33241 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LSP1P33241 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LSP1P33241 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LSP1P33241 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LSP1P33241 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LSP1P33241 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LSP1P33241 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LSP1P33241 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LSP1P33241 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LSP1P33241 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LSP1P33241 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LSP1P33241 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LSP1P33241 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LSP1P33241 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LSP1P33241 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LSP1P33241 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LSP1P33241 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LSP1P33241 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LSP1P33241 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LSP1P33241 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LSP1P33241 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LSP1P33241 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LSP1P33241 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LSP1P33241 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LSP1P33241 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LSP1P33241 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LSP1P33241 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LSP1P33241 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LSP1P33241 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LSP1P33241 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LSP1P33241 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LSP1P33241 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LSP1P33241 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LSP1P33241 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LSP1P33241 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LSP1P33241 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LSP1P33241 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LSP1P33241 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LSP1P33241 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LSP1P33241 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LSP1P33241 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LSP1P33241 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LSP1P33241 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LSP1P33241 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LSP1P33241 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LSP1P33241 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LSP1P33241 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LSP1P33241 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LSP1P33241 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LSP1P33241 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LSP1P33241 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LSP1P33241 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LSP1P33241 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LSP1P33241 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LSP1P33241 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LSP1P33241 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LSP1P33241 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LSP1P33241 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LSP1P33241 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LSP1P33241 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LSP1P33241 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LSP1P33241 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LSP1P33241 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LSP1P33241 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LSP1P33241 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LSP1P33241 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LSP1P33241 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LSP1P33241 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LSP1P33241 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LSP1P33241 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LSP1P33241 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LSP1P33241 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LSP1P33241 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms