Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA3P26006 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA3P26006 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA3P26006 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA3P26006 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA3P26006 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA3P26006 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA3P26006 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA3P26006 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGA3P26006 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGA3P26006 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA3P26006 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA3P26006 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA3P26006 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA3P26006 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA3P26006 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA3P26006 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA3P26006 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA3P26006 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA3P26006 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA3P26006 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA3P26006 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA3P26006 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA3P26006 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA3P26006 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA3P26006 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA3P26006 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA3P26006 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA3P26006 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA3P26006 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA3P26006 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA3P26006 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA3P26006 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA3P26006 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA3P26006 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA3P26006 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA3P26006 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA3P26006 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA3P26006 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA3P26006 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA3P26006 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA3P26006 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA3P26006 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA3P26006 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA3P26006 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGA3P26006 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGA3P26006 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA3P26006 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA3P26006 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA3P26006 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA3P26006 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA3P26006 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA3P26006 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA3P26006 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA3P26006 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA3P26006 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA3P26006 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA3P26006 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA3P26006 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA3P26006 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA3P26006 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA3P26006 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA3P26006 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA3P26006 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA3P26006 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA3P26006 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA3P26006 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA3P26006 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA3P26006 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA3P26006 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA3P26006 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA3P26006 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
ITGA3P26006 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA3P26006 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA3P26006 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA3P26006 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA3P26006 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA3P26006 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA3P26006 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA3P26006 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA3P26006 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA3P26006 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA3P26006 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA3P26006 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA3P26006 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA3P26006 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA3P26006 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA3P26006 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA3P26006 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA3P26006 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA3P26006 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA3P26006 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA3P26006 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA3P26006 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA3P26006 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA3P26006 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA3P26006 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA3P26006 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA3P26006 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA3P26006 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms