Protein–RNA interactions for Protein: P23759

PAX7, Paired box protein Pax-7, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX7P23759 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAX7P23759 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAX7P23759 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PAX7P23759 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAX7P23759 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAX7P23759 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAX7P23759 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAX7P23759 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAX7P23759 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAX7P23759 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAX7P23759 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAX7P23759 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAX7P23759 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAX7P23759 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAX7P23759 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAX7P23759 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PAX7P23759 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PAX7P23759 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAX7P23759 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAX7P23759 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PAX7P23759 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAX7P23759 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAX7P23759 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAX7P23759 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAX7P23759 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAX7P23759 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAX7P23759 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAX7P23759 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAX7P23759 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAX7P23759 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAX7P23759 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAX7P23759 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAX7P23759 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAX7P23759 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAX7P23759 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAX7P23759 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAX7P23759 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAX7P23759 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAX7P23759 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAX7P23759 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAX7P23759 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAX7P23759 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAX7P23759 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAX7P23759 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PAX7P23759 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PAX7P23759 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PAX7P23759 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAX7P23759 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAX7P23759 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAX7P23759 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAX7P23759 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAX7P23759 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAX7P23759 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAX7P23759 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PAX7P23759 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAX7P23759 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAX7P23759 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAX7P23759 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAX7P23759 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAX7P23759 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAX7P23759 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAX7P23759 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAX7P23759 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAX7P23759 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAX7P23759 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAX7P23759 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAX7P23759 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAX7P23759 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAX7P23759 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAX7P23759 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAX7P23759 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAX7P23759 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAX7P23759 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAX7P23759 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAX7P23759 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAX7P23759 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAX7P23759 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PAX7P23759 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAX7P23759 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAX7P23759 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAX7P23759 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAX7P23759 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PAX7P23759 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PAX7P23759 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAX7P23759 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAX7P23759 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAX7P23759 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAX7P23759 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAX7P23759 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAX7P23759 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAX7P23759 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAX7P23759 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAX7P23759 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAX7P23759 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAX7P23759 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAX7P23759 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAX7P23759 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAX7P23759 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PAX7P23759 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAX7P23759 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms