Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGFR3P22607 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGFR3P22607 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGFR3P22607 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGFR3P22607 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGFR3P22607 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGFR3P22607 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGFR3P22607 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FGFR3P22607 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGFR3P22607 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGFR3P22607 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FGFR3P22607 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
FGFR3P22607 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGFR3P22607 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGFR3P22607 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGFR3P22607 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
FGFR3P22607 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGFR3P22607 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGFR3P22607 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FGFR3P22607 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGFR3P22607 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGFR3P22607 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGFR3P22607 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FGFR3P22607 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGFR3P22607 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGFR3P22607 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FGFR3P22607 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FGFR3P22607 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FGFR3P22607 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
FGFR3P22607 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FGFR3P22607 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FGFR3P22607 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FGFR3P22607 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FGFR3P22607 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FGFR3P22607 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGFR3P22607 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGFR3P22607 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FGFR3P22607 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGFR3P22607 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGFR3P22607 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGFR3P22607 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGFR3P22607 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGFR3P22607 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGFR3P22607 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGFR3P22607 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGFR3P22607 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGFR3P22607 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGFR3P22607 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGFR3P22607 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGFR3P22607 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FGFR3P22607 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
FGFR3P22607 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FGFR3P22607 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGFR3P22607 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGFR3P22607 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGFR3P22607 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGFR3P22607 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FGFR3P22607 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
FGFR3P22607 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGFR3P22607 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGFR3P22607 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGFR3P22607 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGFR3P22607 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGFR3P22607 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGFR3P22607 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGFR3P22607 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGFR3P22607 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
FGFR3P22607 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGFR3P22607 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGFR3P22607 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
FGFR3P22607 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGFR3P22607 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
FGFR3P22607 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGFR3P22607 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGFR3P22607 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGFR3P22607 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGFR3P22607 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGFR3P22607 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGFR3P22607 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGFR3P22607 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGFR3P22607 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGFR3P22607 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FGFR3P22607 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGFR3P22607 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGFR3P22607 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGFR3P22607 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FGFR3P22607 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FGFR3P22607 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FGFR3P22607 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FGFR3P22607 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGFR3P22607 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGFR3P22607 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGFR3P22607 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGFR3P22607 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGFR3P22607 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FGFR3P22607 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FGFR3P22607 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FGFR3P22607 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FGFR3P22607 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
FGFR3P22607 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms