Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPRR1BP22528 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPRR1BP22528 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPRR1BP22528 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPRR1BP22528 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPRR1BP22528 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPRR1BP22528 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPRR1BP22528 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPRR1BP22528 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPRR1BP22528 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPRR1BP22528 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPRR1BP22528 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPRR1BP22528 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPRR1BP22528 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPRR1BP22528 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPRR1BP22528 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPRR1BP22528 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPRR1BP22528 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPRR1BP22528 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPRR1BP22528 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPRR1BP22528 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPRR1BP22528 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPRR1BP22528 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPRR1BP22528 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPRR1BP22528 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPRR1BP22528 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPRR1BP22528 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPRR1BP22528 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPRR1BP22528 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPRR1BP22528 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPRR1BP22528 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPRR1BP22528 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPRR1BP22528 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPRR1BP22528 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPRR1BP22528 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPRR1BP22528 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPRR1BP22528 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPRR1BP22528 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPRR1BP22528 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPRR1BP22528 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPRR1BP22528 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPRR1BP22528 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPRR1BP22528 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPRR1BP22528 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRR1BP22528 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRR1BP22528 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRR1BP22528 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRR1BP22528 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRR1BP22528 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRR1BP22528 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPRR1BP22528 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPRR1BP22528 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SPRR1BP22528 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPRR1BP22528 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SPRR1BP22528 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPRR1BP22528 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPRR1BP22528 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPRR1BP22528 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPRR1BP22528 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms