Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP4AP20648 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP4AP20648 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP4AP20648 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP4AP20648 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP4AP20648 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP4AP20648 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP4AP20648 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP4AP20648 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP4AP20648 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP4AP20648 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP4AP20648 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP4AP20648 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP4AP20648 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP4AP20648 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP4AP20648 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP4AP20648 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP4AP20648 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP4AP20648 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATP4AP20648 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP4AP20648 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP4AP20648 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP4AP20648 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP4AP20648 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP4AP20648 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP4AP20648 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP4AP20648 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP4AP20648 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP4AP20648 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP4AP20648 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP4AP20648 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP4AP20648 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP4AP20648 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP4AP20648 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP4AP20648 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP4AP20648 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP4AP20648 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP4AP20648 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATP4AP20648 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP4AP20648 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP4AP20648 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP4AP20648 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP4AP20648 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP4AP20648 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP4AP20648 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP4AP20648 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP4AP20648 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP4AP20648 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP4AP20648 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP4AP20648 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP4AP20648 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP4AP20648 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP4AP20648 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP4AP20648 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP4AP20648 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP4AP20648 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP4AP20648 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP4AP20648 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP4AP20648 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP4AP20648 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP4AP20648 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP4AP20648 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP4AP20648 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP4AP20648 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP4AP20648 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP4AP20648 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP4AP20648 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP4AP20648 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP4AP20648 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP4AP20648 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP4AP20648 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP4AP20648 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP4AP20648 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP4AP20648 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP4AP20648 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP4AP20648 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP4AP20648 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP4AP20648 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP4AP20648 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP4AP20648 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP4AP20648 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP4AP20648 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP4AP20648 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP4AP20648 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP4AP20648 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP4AP20648 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP4AP20648 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP4AP20648 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP4AP20648 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP4AP20648 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP4AP20648 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP4AP20648 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP4AP20648 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP4AP20648 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP4AP20648 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP4AP20648 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP4AP20648 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP4AP20648 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP4AP20648 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP4AP20648 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms