Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT4P19013 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT4P19013 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT4P19013 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT4P19013 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT4P19013 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT4P19013 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT4P19013 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT4P19013 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT4P19013 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT4P19013 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT4P19013 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT4P19013 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT4P19013 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT4P19013 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT4P19013 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT4P19013 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT4P19013 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT4P19013 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT4P19013 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT4P19013 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT4P19013 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT4P19013 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT4P19013 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT4P19013 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT4P19013 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT4P19013 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT4P19013 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT4P19013 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT4P19013 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT4P19013 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT4P19013 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT4P19013 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT4P19013 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT4P19013 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT4P19013 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT4P19013 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT4P19013 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT4P19013 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT4P19013 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KRT4P19013 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT4P19013 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT4P19013 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT4P19013 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT4P19013 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT4P19013 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT4P19013 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT4P19013 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT4P19013 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT4P19013 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT4P19013 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT4P19013 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT4P19013 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT4P19013 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT4P19013 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT4P19013 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT4P19013 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT4P19013 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT4P19013 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT4P19013 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT4P19013 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT4P19013 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT4P19013 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT4P19013 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT4P19013 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT4P19013 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT4P19013 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT4P19013 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT4P19013 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT4P19013 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT4P19013 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT4P19013 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT4P19013 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT4P19013 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT4P19013 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT4P19013 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT4P19013 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT4P19013 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT4P19013 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT4P19013 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT4P19013 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT4P19013 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT4P19013 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT4P19013 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT4P19013 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT4P19013 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT4P19013 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT4P19013 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT4P19013 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT4P19013 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT4P19013 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT4P19013 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT4P19013 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT4P19013 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT4P19013 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT4P19013 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT4P19013 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT4P19013 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT4P19013 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT4P19013 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms