Protein–RNA interactions for Protein: P18887

XRCC1, DNA repair protein XRCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC1P18887 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XRCC1P18887 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
XRCC1P18887 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XRCC1P18887 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
XRCC1P18887 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XRCC1P18887 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XRCC1P18887 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XRCC1P18887 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
XRCC1P18887 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XRCC1P18887 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XRCC1P18887 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XRCC1P18887 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XRCC1P18887 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
XRCC1P18887 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XRCC1P18887 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
XRCC1P18887 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
XRCC1P18887 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XRCC1P18887 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XRCC1P18887 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XRCC1P18887 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XRCC1P18887 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XRCC1P18887 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XRCC1P18887 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XRCC1P18887 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XRCC1P18887 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XRCC1P18887 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XRCC1P18887 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XRCC1P18887 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XRCC1P18887 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XRCC1P18887 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XRCC1P18887 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XRCC1P18887 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XRCC1P18887 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XRCC1P18887 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
XRCC1P18887 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XRCC1P18887 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XRCC1P18887 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XRCC1P18887 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XRCC1P18887 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
XRCC1P18887 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
XRCC1P18887 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
XRCC1P18887 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
XRCC1P18887 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XRCC1P18887 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
XRCC1P18887 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XRCC1P18887 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XRCC1P18887 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
XRCC1P18887 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
XRCC1P18887 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
XRCC1P18887 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XRCC1P18887 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XRCC1P18887 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XRCC1P18887 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
XRCC1P18887 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
XRCC1P18887 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
XRCC1P18887 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
XRCC1P18887 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
XRCC1P18887 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
XRCC1P18887 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
XRCC1P18887 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
XRCC1P18887 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
XRCC1P18887 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
XRCC1P18887 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
XRCC1P18887 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XRCC1P18887 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XRCC1P18887 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XRCC1P18887 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XRCC1P18887 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XRCC1P18887 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XRCC1P18887 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XRCC1P18887 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XRCC1P18887 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XRCC1P18887 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
XRCC1P18887 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XRCC1P18887 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XRCC1P18887 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XRCC1P18887 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
XRCC1P18887 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XRCC1P18887 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XRCC1P18887 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
XRCC1P18887 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XRCC1P18887 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
XRCC1P18887 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
XRCC1P18887 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XRCC1P18887 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XRCC1P18887 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XRCC1P18887 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
XRCC1P18887 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XRCC1P18887 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
XRCC1P18887 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
XRCC1P18887 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XRCC1P18887 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
XRCC1P18887 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
XRCC1P18887 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
XRCC1P18887 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
XRCC1P18887 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
XRCC1P18887 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
XRCC1P18887 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
XRCC1P18887 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
XRCC1P18887 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms