Protein–RNA interactions for Protein: P17509

HOXB6, Homeobox protein Hox-B6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB6P17509 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXB6P17509 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB6P17509 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB6P17509 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB6P17509 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB6P17509 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB6P17509 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXB6P17509 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB6P17509 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB6P17509 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB6P17509 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB6P17509 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB6P17509 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB6P17509 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
HOXB6P17509 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB6P17509 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB6P17509 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB6P17509 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB6P17509 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB6P17509 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB6P17509 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB6P17509 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB6P17509 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB6P17509 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB6P17509 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB6P17509 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB6P17509 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB6P17509 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB6P17509 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB6P17509 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB6P17509 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB6P17509 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB6P17509 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB6P17509 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB6P17509 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB6P17509 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB6P17509 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB6P17509 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB6P17509 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB6P17509 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB6P17509 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB6P17509 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB6P17509 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB6P17509 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB6P17509 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB6P17509 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB6P17509 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB6P17509 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB6P17509 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB6P17509 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB6P17509 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB6P17509 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB6P17509 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB6P17509 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB6P17509 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB6P17509 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB6P17509 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB6P17509 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB6P17509 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB6P17509 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB6P17509 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB6P17509 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB6P17509 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB6P17509 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB6P17509 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB6P17509 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB6P17509 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB6P17509 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB6P17509 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB6P17509 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB6P17509 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB6P17509 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB6P17509 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB6P17509 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB6P17509 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB6P17509 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB6P17509 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB6P17509 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB6P17509 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB6P17509 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB6P17509 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB6P17509 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB6P17509 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB6P17509 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB6P17509 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB6P17509 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB6P17509 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB6P17509 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB6P17509 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB6P17509 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB6P17509 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB6P17509 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXB6P17509 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXB6P17509 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXB6P17509 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXB6P17509 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXB6P17509 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXB6P17509 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXB6P17509 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXB6P17509 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms