Protein–RNA interactions for Protein: P17040

ZSCAN20, Zinc finger and SCAN domain-containing protein 20, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSCAN20P17040 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZSCAN20P17040 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZSCAN20P17040 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZSCAN20P17040 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZSCAN20P17040 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZSCAN20P17040 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZSCAN20P17040 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ZSCAN20P17040 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZSCAN20P17040 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZSCAN20P17040 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZSCAN20P17040 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZSCAN20P17040 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZSCAN20P17040 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZSCAN20P17040 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ZSCAN20P17040 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZSCAN20P17040 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZSCAN20P17040 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZSCAN20P17040 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZSCAN20P17040 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZSCAN20P17040 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZSCAN20P17040 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZSCAN20P17040 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZSCAN20P17040 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZSCAN20P17040 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZSCAN20P17040 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZSCAN20P17040 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZSCAN20P17040 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZSCAN20P17040 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZSCAN20P17040 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZSCAN20P17040 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZSCAN20P17040 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZSCAN20P17040 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZSCAN20P17040 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZSCAN20P17040 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZSCAN20P17040 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZSCAN20P17040 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZSCAN20P17040 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ZSCAN20P17040 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZSCAN20P17040 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZSCAN20P17040 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZSCAN20P17040 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZSCAN20P17040 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZSCAN20P17040 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZSCAN20P17040 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZSCAN20P17040 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZSCAN20P17040 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZSCAN20P17040 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZSCAN20P17040 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZSCAN20P17040 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZSCAN20P17040 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZSCAN20P17040 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZSCAN20P17040 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZSCAN20P17040 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZSCAN20P17040 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ZSCAN20P17040 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZSCAN20P17040 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZSCAN20P17040 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZSCAN20P17040 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZSCAN20P17040 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZSCAN20P17040 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ZSCAN20P17040 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZSCAN20P17040 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZSCAN20P17040 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZSCAN20P17040 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ZSCAN20P17040 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZSCAN20P17040 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZSCAN20P17040 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZSCAN20P17040 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ZSCAN20P17040 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZSCAN20P17040 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZSCAN20P17040 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZSCAN20P17040 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZSCAN20P17040 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZSCAN20P17040 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZSCAN20P17040 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZSCAN20P17040 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZSCAN20P17040 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZSCAN20P17040 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZSCAN20P17040 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZSCAN20P17040 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZSCAN20P17040 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZSCAN20P17040 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZSCAN20P17040 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZSCAN20P17040 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZSCAN20P17040 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZSCAN20P17040 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZSCAN20P17040 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZSCAN20P17040 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZSCAN20P17040 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZSCAN20P17040 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZSCAN20P17040 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZSCAN20P17040 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZSCAN20P17040 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZSCAN20P17040 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZSCAN20P17040 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZSCAN20P17040 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZSCAN20P17040 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZSCAN20P17040 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZSCAN20P17040 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ZSCAN20P17040 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms