Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD46P15529 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD46P15529 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD46P15529 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CD46P15529 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD46P15529 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD46P15529 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CD46P15529 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD46P15529 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CD46P15529 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD46P15529 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD46P15529 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD46P15529 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD46P15529 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD46P15529 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD46P15529 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD46P15529 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD46P15529 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD46P15529 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD46P15529 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD46P15529 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD46P15529 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD46P15529 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD46P15529 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD46P15529 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD46P15529 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD46P15529 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD46P15529 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD46P15529 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD46P15529 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD46P15529 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD46P15529 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CD46P15529 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD46P15529 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CD46P15529 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD46P15529 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD46P15529 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD46P15529 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD46P15529 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CD46P15529 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD46P15529 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD46P15529 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CD46P15529 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD46P15529 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD46P15529 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD46P15529 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD46P15529 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD46P15529 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD46P15529 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD46P15529 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD46P15529 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD46P15529 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD46P15529 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD46P15529 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD46P15529 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD46P15529 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD46P15529 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD46P15529 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD46P15529 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CD46P15529 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD46P15529 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD46P15529 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD46P15529 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD46P15529 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CD46P15529 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CD46P15529 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD46P15529 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD46P15529 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD46P15529 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD46P15529 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD46P15529 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD46P15529 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD46P15529 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD46P15529 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD46P15529 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD46P15529 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD46P15529 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD46P15529 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD46P15529 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD46P15529 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD46P15529 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD46P15529 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD46P15529 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD46P15529 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD46P15529 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD46P15529 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD46P15529 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CD46P15529 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD46P15529 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD46P15529 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD46P15529 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD46P15529 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD46P15529 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD46P15529 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD46P15529 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD46P15529 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD46P15529 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CD46P15529 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD46P15529 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD46P15529 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms