Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRAFP15056 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRAFP15056 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRAFP15056 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRAFP15056 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRAFP15056 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRAFP15056 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRAFP15056 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRAFP15056 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRAFP15056 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRAFP15056 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRAFP15056 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRAFP15056 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRAFP15056 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRAFP15056 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRAFP15056 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRAFP15056 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRAFP15056 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRAFP15056 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRAFP15056 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRAFP15056 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRAFP15056 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRAFP15056 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRAFP15056 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRAFP15056 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRAFP15056 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRAFP15056 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRAFP15056 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
BRAFP15056 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRAFP15056 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRAFP15056 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRAFP15056 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRAFP15056 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRAFP15056 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRAFP15056 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRAFP15056 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRAFP15056 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRAFP15056 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRAFP15056 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRAFP15056 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRAFP15056 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
BRAFP15056 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRAFP15056 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRAFP15056 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRAFP15056 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRAFP15056 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
BRAFP15056 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRAFP15056 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRAFP15056 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRAFP15056 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRAFP15056 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRAFP15056 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRAFP15056 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRAFP15056 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRAFP15056 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRAFP15056 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRAFP15056 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRAFP15056 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRAFP15056 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRAFP15056 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRAFP15056 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRAFP15056 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRAFP15056 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRAFP15056 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
BRAFP15056 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRAFP15056 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRAFP15056 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRAFP15056 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRAFP15056 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRAFP15056 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BRAFP15056 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRAFP15056 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRAFP15056 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRAFP15056 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
BRAFP15056 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRAFP15056 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRAFP15056 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRAFP15056 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRAFP15056 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRAFP15056 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRAFP15056 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRAFP15056 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRAFP15056 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRAFP15056 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRAFP15056 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRAFP15056 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRAFP15056 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRAFP15056 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRAFP15056 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRAFP15056 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRAFP15056 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRAFP15056 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRAFP15056 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRAFP15056 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRAFP15056 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRAFP15056 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRAFP15056 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRAFP15056 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRAFP15056 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRAFP15056 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms