Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRKCSHP14314 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRKCSHP14314 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRKCSHP14314 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRKCSHP14314 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRKCSHP14314 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRKCSHP14314 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRKCSHP14314 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PRKCSHP14314 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
PRKCSHP14314 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRKCSHP14314 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRKCSHP14314 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRKCSHP14314 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PRKCSHP14314 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRKCSHP14314 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRKCSHP14314 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRKCSHP14314 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PRKCSHP14314 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PRKCSHP14314 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRKCSHP14314 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRKCSHP14314 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRKCSHP14314 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRKCSHP14314 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRKCSHP14314 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRKCSHP14314 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRKCSHP14314 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRKCSHP14314 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRKCSHP14314 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRKCSHP14314 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRKCSHP14314 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRKCSHP14314 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRKCSHP14314 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PRKCSHP14314 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRKCSHP14314 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PRKCSHP14314 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRKCSHP14314 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRKCSHP14314 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRKCSHP14314 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRKCSHP14314 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRKCSHP14314 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRKCSHP14314 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRKCSHP14314 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRKCSHP14314 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRKCSHP14314 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRKCSHP14314 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRKCSHP14314 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRKCSHP14314 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRKCSHP14314 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRKCSHP14314 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRKCSHP14314 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRKCSHP14314 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRKCSHP14314 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRKCSHP14314 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRKCSHP14314 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
PRKCSHP14314 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRKCSHP14314 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRKCSHP14314 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRKCSHP14314 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRKCSHP14314 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRKCSHP14314 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRKCSHP14314 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRKCSHP14314 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRKCSHP14314 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRKCSHP14314 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRKCSHP14314 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRKCSHP14314 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRKCSHP14314 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRKCSHP14314 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRKCSHP14314 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRKCSHP14314 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRKCSHP14314 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRKCSHP14314 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRKCSHP14314 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRKCSHP14314 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRKCSHP14314 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRKCSHP14314 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRKCSHP14314 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRKCSHP14314 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRKCSHP14314 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PRKCSHP14314 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRKCSHP14314 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRKCSHP14314 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRKCSHP14314 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRKCSHP14314 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PRKCSHP14314 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRKCSHP14314 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRKCSHP14314 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRKCSHP14314 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRKCSHP14314 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRKCSHP14314 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRKCSHP14314 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRKCSHP14314 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRKCSHP14314 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRKCSHP14314 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRKCSHP14314 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRKCSHP14314 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRKCSHP14314 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRKCSHP14314 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PRKCSHP14314 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRKCSHP14314 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms