Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT13P13646 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT13P13646 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT13P13646 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KRT13P13646 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT13P13646 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT13P13646 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KRT13P13646 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT13P13646 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT13P13646 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT13P13646 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KRT13P13646 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
KRT13P13646 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KRT13P13646 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT13P13646 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT13P13646 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT13P13646 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT13P13646 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT13P13646 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT13P13646 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT13P13646 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT13P13646 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT13P13646 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT13P13646 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT13P13646 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT13P13646 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT13P13646 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT13P13646 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT13P13646 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT13P13646 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT13P13646 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KRT13P13646 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KRT13P13646 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT13P13646 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT13P13646 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT13P13646 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT13P13646 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT13P13646 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT13P13646 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT13P13646 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT13P13646 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT13P13646 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT13P13646 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT13P13646 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT13P13646 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT13P13646 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT13P13646 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT13P13646 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT13P13646 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT13P13646 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT13P13646 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT13P13646 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT13P13646 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT13P13646 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KRT13P13646 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT13P13646 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT13P13646 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT13P13646 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KRT13P13646 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
KRT13P13646 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT13P13646 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT13P13646 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT13P13646 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT13P13646 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT13P13646 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KRT13P13646 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT13P13646 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT13P13646 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT13P13646 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT13P13646 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT13P13646 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KRT13P13646 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT13P13646 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT13P13646 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT13P13646 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT13P13646 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT13P13646 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT13P13646 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT13P13646 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT13P13646 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT13P13646 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT13P13646 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT13P13646 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT13P13646 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT13P13646 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT13P13646 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT13P13646 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT13P13646 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT13P13646 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT13P13646 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT13P13646 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT13P13646 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT13P13646 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT13P13646 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT13P13646 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT13P13646 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT13P13646 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT13P13646 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT13P13646 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT13P13646 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms