Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GP1BBP13224 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GP1BBP13224 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GP1BBP13224 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GP1BBP13224 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GP1BBP13224 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GP1BBP13224 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GP1BBP13224 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GP1BBP13224 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GP1BBP13224 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GP1BBP13224 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GP1BBP13224 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GP1BBP13224 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GP1BBP13224 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GP1BBP13224 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GP1BBP13224 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GP1BBP13224 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GP1BBP13224 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GP1BBP13224 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GP1BBP13224 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GP1BBP13224 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GP1BBP13224 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GP1BBP13224 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GP1BBP13224 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GP1BBP13224 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GP1BBP13224 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GP1BBP13224 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GP1BBP13224 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GP1BBP13224 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GP1BBP13224 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GP1BBP13224 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GP1BBP13224 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GP1BBP13224 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GP1BBP13224 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GP1BBP13224 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GP1BBP13224 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GP1BBP13224 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GP1BBP13224 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GP1BBP13224 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GP1BBP13224 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GP1BBP13224 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GP1BBP13224 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GP1BBP13224 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GP1BBP13224 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GP1BBP13224 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GP1BBP13224 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GP1BBP13224 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GP1BBP13224 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GP1BBP13224 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GP1BBP13224 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GP1BBP13224 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GP1BBP13224 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GP1BBP13224 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
GP1BBP13224 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GP1BBP13224 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GP1BBP13224 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GP1BBP13224 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GP1BBP13224 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GP1BBP13224 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GP1BBP13224 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GP1BBP13224 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GP1BBP13224 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GP1BBP13224 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GP1BBP13224 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GP1BBP13224 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GP1BBP13224 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GP1BBP13224 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GP1BBP13224 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GP1BBP13224 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GP1BBP13224 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GP1BBP13224 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GP1BBP13224 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GP1BBP13224 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GP1BBP13224 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GP1BBP13224 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GP1BBP13224 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GP1BBP13224 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GP1BBP13224 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GP1BBP13224 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GP1BBP13224 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GP1BBP13224 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GP1BBP13224 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GP1BBP13224 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GP1BBP13224 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GP1BBP13224 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GP1BBP13224 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GP1BBP13224 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GP1BBP13224 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GP1BBP13224 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GP1BBP13224 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GP1BBP13224 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GP1BBP13224 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GP1BBP13224 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GP1BBP13224 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GP1BBP13224 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GP1BBP13224 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GP1BBP13224 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GP1BBP13224 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GP1BBP13224 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GP1BBP13224 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms