Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RLBP1P12271 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RLBP1P12271 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RLBP1P12271 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
RLBP1P12271 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RLBP1P12271 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
RLBP1P12271 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
RLBP1P12271 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
RLBP1P12271 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RLBP1P12271 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RLBP1P12271 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
RLBP1P12271 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
RLBP1P12271 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
RLBP1P12271 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
RLBP1P12271 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RLBP1P12271 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RLBP1P12271 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RLBP1P12271 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RLBP1P12271 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
RLBP1P12271 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
RLBP1P12271 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RLBP1P12271 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RLBP1P12271 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RLBP1P12271 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RLBP1P12271 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RLBP1P12271 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RLBP1P12271 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RLBP1P12271 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RLBP1P12271 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RLBP1P12271 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RLBP1P12271 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RLBP1P12271 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
RLBP1P12271 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RLBP1P12271 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RLBP1P12271 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RLBP1P12271 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RLBP1P12271 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
RLBP1P12271 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RLBP1P12271 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RLBP1P12271 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RLBP1P12271 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RLBP1P12271 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RLBP1P12271 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RLBP1P12271 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RLBP1P12271 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RLBP1P12271 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RLBP1P12271 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RLBP1P12271 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RLBP1P12271 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
RLBP1P12271 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RLBP1P12271 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RLBP1P12271 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RLBP1P12271 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RLBP1P12271 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
RLBP1P12271 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RLBP1P12271 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RLBP1P12271 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RLBP1P12271 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RLBP1P12271 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RLBP1P12271 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RLBP1P12271 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
RLBP1P12271 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RLBP1P12271 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RLBP1P12271 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RLBP1P12271 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RLBP1P12271 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RLBP1P12271 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RLBP1P12271 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RLBP1P12271 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RLBP1P12271 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RLBP1P12271 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RLBP1P12271 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
RLBP1P12271 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
RLBP1P12271 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RLBP1P12271 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RLBP1P12271 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RLBP1P12271 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RLBP1P12271 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RLBP1P12271 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RLBP1P12271 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RLBP1P12271 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RLBP1P12271 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RLBP1P12271 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RLBP1P12271 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RLBP1P12271 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RLBP1P12271 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RLBP1P12271 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RLBP1P12271 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RLBP1P12271 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RLBP1P12271 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RLBP1P12271 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RLBP1P12271 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RLBP1P12271 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RLBP1P12271 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RLBP1P12271 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RLBP1P12271 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RLBP1P12271 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RLBP1P12271 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RLBP1P12271 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RLBP1P12271 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms