Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFHP12036 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFHP12036 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFHP12036 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFHP12036 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFHP12036 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFHP12036 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEFHP12036 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEFHP12036 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEFHP12036 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEFHP12036 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEFHP12036 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
NEFHP12036 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFHP12036 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFHP12036 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFHP12036 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFHP12036 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFHP12036 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFHP12036 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFHP12036 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFHP12036 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFHP12036 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFHP12036 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFHP12036 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFHP12036 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFHP12036 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFHP12036 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFHP12036 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEFHP12036 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEFHP12036 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEFHP12036 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEFHP12036 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEFHP12036 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEFHP12036 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEFHP12036 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEFHP12036 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEFHP12036 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEFHP12036 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFHP12036 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFHP12036 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEFHP12036 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFHP12036 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFHP12036 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFHP12036 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFHP12036 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEFHP12036 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFHP12036 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFHP12036 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFHP12036 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFHP12036 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFHP12036 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFHP12036 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFHP12036 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEFHP12036 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFHP12036 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFHP12036 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFHP12036 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFHP12036 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFHP12036 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEFHP12036 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFHP12036 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFHP12036 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFHP12036 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEFHP12036 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFHP12036 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFHP12036 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFHP12036 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFHP12036 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEFHP12036 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFHP12036 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFHP12036 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFHP12036 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFHP12036 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFHP12036 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFHP12036 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFHP12036 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NEFHP12036 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEFHP12036 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEFHP12036 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEFHP12036 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFHP12036 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFHP12036 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFHP12036 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEFHP12036 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFHP12036 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFHP12036 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFHP12036 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFHP12036 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEFHP12036 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFHP12036 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFHP12036 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFHP12036 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFHP12036 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFHP12036 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFHP12036 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEFHP12036 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NEFHP12036 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEFHP12036 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEFHP12036 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEFHP12036 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms