Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOP1P11387 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOP1P11387 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOP1P11387 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOP1P11387 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOP1P11387 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOP1P11387 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOP1P11387 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOP1P11387 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TOP1P11387 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TOP1P11387 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TOP1P11387 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TOP1P11387 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TOP1P11387 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TOP1P11387 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOP1P11387 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOP1P11387 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOP1P11387 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOP1P11387 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOP1P11387 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOP1P11387 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOP1P11387 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOP1P11387 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOP1P11387 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOP1P11387 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOP1P11387 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOP1P11387 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
TOP1P11387 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP1P11387 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP1P11387 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP1P11387 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP1P11387 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOP1P11387 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOP1P11387 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOP1P11387 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOP1P11387 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TOP1P11387 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TOP1P11387 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TOP1P11387 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TOP1P11387 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TOP1P11387 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TOP1P11387 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TOP1P11387 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TOP1P11387 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TOP1P11387 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TOP1P11387 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TOP1P11387 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TOP1P11387 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TOP1P11387 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TOP1P11387 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TOP1P11387 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOP1P11387 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOP1P11387 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOP1P11387 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOP1P11387 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOP1P11387 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOP1P11387 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOP1P11387 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOP1P11387 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOP1P11387 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOP1P11387 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOP1P11387 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TOP1P11387 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TOP1P11387 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TOP1P11387 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TOP1P11387 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TOP1P11387 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TOP1P11387 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TOP1P11387 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP1P11387 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP1P11387 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP1P11387 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP1P11387 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP1P11387 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP1P11387 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TOP1P11387 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP1P11387 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP1P11387 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP1P11387 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP1P11387 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP1P11387 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TOP1P11387 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP1P11387 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP1P11387 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP1P11387 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP1P11387 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP1P11387 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP1P11387 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP1P11387 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP1P11387 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP1P11387 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOP1P11387 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOP1P11387 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TOP1P11387 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TOP1P11387 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TOP1P11387 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TOP1P11387 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TOP1P11387 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TOP1P11387 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TOP1P11387 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms