Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRF1P10914 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRF1P10914 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRF1P10914 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
IRF1P10914 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRF1P10914 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
IRF1P10914 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRF1P10914 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRF1P10914 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
IRF1P10914 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRF1P10914 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
IRF1P10914 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IRF1P10914 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IRF1P10914 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRF1P10914 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRF1P10914 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRF1P10914 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRF1P10914 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRF1P10914 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRF1P10914 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRF1P10914 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRF1P10914 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRF1P10914 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRF1P10914 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRF1P10914 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRF1P10914 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRF1P10914 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRF1P10914 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRF1P10914 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRF1P10914 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRF1P10914 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRF1P10914 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRF1P10914 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRF1P10914 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRF1P10914 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRF1P10914 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRF1P10914 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRF1P10914 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRF1P10914 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IRF1P10914 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IRF1P10914 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IRF1P10914 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IRF1P10914 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IRF1P10914 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IRF1P10914 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IRF1P10914 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IRF1P10914 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IRF1P10914 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
IRF1P10914 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IRF1P10914 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
IRF1P10914 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IRF1P10914 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IRF1P10914 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IRF1P10914 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IRF1P10914 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IRF1P10914 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IRF1P10914 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IRF1P10914 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IRF1P10914 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IRF1P10914 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IRF1P10914 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IRF1P10914 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IRF1P10914 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IRF1P10914 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IRF1P10914 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IRF1P10914 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IRF1P10914 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IRF1P10914 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IRF1P10914 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IRF1P10914 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IRF1P10914 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IRF1P10914 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
IRF1P10914 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRF1P10914 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRF1P10914 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRF1P10914 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRF1P10914 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
IRF1P10914 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
IRF1P10914 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
IRF1P10914 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IRF1P10914 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IRF1P10914 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRF1P10914 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRF1P10914 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRF1P10914 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRF1P10914 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRF1P10914 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
IRF1P10914 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRF1P10914 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRF1P10914 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRF1P10914 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRF1P10914 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
IRF1P10914 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
IRF1P10914 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IRF1P10914 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IRF1P10914 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IRF1P10914 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IRF1P10914 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IRF1P10914 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IRF1P10914 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms