Protein–RNA interactions for Protein: P0DMP2

SRGAP2B, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2BP0DMP2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SRGAP2BP0DMP2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SRGAP2BP0DMP2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SRGAP2BP0DMP2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRGAP2BP0DMP2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRGAP2BP0DMP2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRGAP2BP0DMP2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRGAP2BP0DMP2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRGAP2BP0DMP2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRGAP2BP0DMP2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRGAP2BP0DMP2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRGAP2BP0DMP2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRGAP2BP0DMP2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SRGAP2BP0DMP2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SRGAP2BP0DMP2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRGAP2BP0DMP2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRGAP2BP0DMP2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRGAP2BP0DMP2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRGAP2BP0DMP2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRGAP2BP0DMP2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SRGAP2BP0DMP2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SRGAP2BP0DMP2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRGAP2BP0DMP2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SRGAP2BP0DMP2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRGAP2BP0DMP2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRGAP2BP0DMP2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRGAP2BP0DMP2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRGAP2BP0DMP2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SRGAP2BP0DMP2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRGAP2BP0DMP2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SRGAP2BP0DMP2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRGAP2BP0DMP2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRGAP2BP0DMP2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SRGAP2BP0DMP2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRGAP2BP0DMP2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRGAP2BP0DMP2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRGAP2BP0DMP2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRGAP2BP0DMP2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SRGAP2BP0DMP2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SRGAP2BP0DMP2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRGAP2BP0DMP2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SRGAP2BP0DMP2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRGAP2BP0DMP2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SRGAP2BP0DMP2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRGAP2BP0DMP2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRGAP2BP0DMP2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRGAP2BP0DMP2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRGAP2BP0DMP2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRGAP2BP0DMP2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRGAP2BP0DMP2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRGAP2BP0DMP2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRGAP2BP0DMP2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRGAP2BP0DMP2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRGAP2BP0DMP2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRGAP2BP0DMP2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRGAP2BP0DMP2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRGAP2BP0DMP2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRGAP2BP0DMP2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRGAP2BP0DMP2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRGAP2BP0DMP2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRGAP2BP0DMP2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRGAP2BP0DMP2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SRGAP2BP0DMP2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRGAP2BP0DMP2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRGAP2BP0DMP2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRGAP2BP0DMP2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRGAP2BP0DMP2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRGAP2BP0DMP2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SRGAP2BP0DMP2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SRGAP2BP0DMP2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRGAP2BP0DMP2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRGAP2BP0DMP2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SRGAP2BP0DMP2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRGAP2BP0DMP2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRGAP2BP0DMP2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRGAP2BP0DMP2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRGAP2BP0DMP2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRGAP2BP0DMP2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRGAP2BP0DMP2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRGAP2BP0DMP2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRGAP2BP0DMP2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRGAP2BP0DMP2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRGAP2BP0DMP2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRGAP2BP0DMP2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRGAP2BP0DMP2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRGAP2BP0DMP2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRGAP2BP0DMP2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRGAP2BP0DMP2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRGAP2BP0DMP2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRGAP2BP0DMP2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRGAP2BP0DMP2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRGAP2BP0DMP2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SRGAP2BP0DMP2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SRGAP2BP0DMP2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRGAP2BP0DMP2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRGAP2BP0DMP2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SRGAP2BP0DMP2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SRGAP2BP0DMP2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SRGAP2BP0DMP2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SRGAP2BP0DMP2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms