Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGA3P0DJD8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGA3P0DJD8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGA3P0DJD8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGA3P0DJD8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGA3P0DJD8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGA3P0DJD8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGA3P0DJD8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGA3P0DJD8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGA3P0DJD8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGA3P0DJD8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGA3P0DJD8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGA3P0DJD8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGA3P0DJD8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGA3P0DJD8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGA3P0DJD8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGA3P0DJD8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGA3P0DJD8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGA3P0DJD8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGA3P0DJD8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGA3P0DJD8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGA3P0DJD8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGA3P0DJD8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGA3P0DJD8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGA3P0DJD8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PGA3P0DJD8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGA3P0DJD8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGA3P0DJD8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGA3P0DJD8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGA3P0DJD8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PGA3P0DJD8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGA3P0DJD8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGA3P0DJD8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PGA3P0DJD8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGA3P0DJD8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGA3P0DJD8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGA3P0DJD8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGA3P0DJD8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGA3P0DJD8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGA3P0DJD8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGA3P0DJD8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PGA3P0DJD8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PGA3P0DJD8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGA3P0DJD8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGA3P0DJD8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGA3P0DJD8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGA3P0DJD8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PGA3P0DJD8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGA3P0DJD8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PGA3P0DJD8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGA3P0DJD8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PGA3P0DJD8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGA3P0DJD8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PGA3P0DJD8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGA3P0DJD8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGA3P0DJD8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGA3P0DJD8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGA3P0DJD8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGA3P0DJD8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGA3P0DJD8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGA3P0DJD8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGA3P0DJD8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGA3P0DJD8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGA3P0DJD8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGA3P0DJD8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGA3P0DJD8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGA3P0DJD8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGA3P0DJD8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGA3P0DJD8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGA3P0DJD8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGA3P0DJD8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGA3P0DJD8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGA3P0DJD8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGA3P0DJD8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGA3P0DJD8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGA3P0DJD8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGA3P0DJD8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGA3P0DJD8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGA3P0DJD8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGA3P0DJD8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGA3P0DJD8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGA3P0DJD8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PGA3P0DJD8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGA3P0DJD8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGA3P0DJD8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGA3P0DJD8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGA3P0DJD8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGA3P0DJD8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGA3P0DJD8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGA3P0DJD8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGA3P0DJD8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGA3P0DJD8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGA3P0DJD8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGA3P0DJD8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGA3P0DJD8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGA3P0DJD8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGA3P0DJD8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGA3P0DJD8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGA3P0DJD8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGA3P0DJD8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms