Protein–RNA interactions for Protein: P0CG33

GOLGA6D, Golgin subfamily A member 6D, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6DP0CG33 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GOLGA6DP0CG33 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GOLGA6DP0CG33 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GOLGA6DP0CG33 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GOLGA6DP0CG33 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GOLGA6DP0CG33 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GOLGA6DP0CG33 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GOLGA6DP0CG33 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GOLGA6DP0CG33 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GOLGA6DP0CG33 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GOLGA6DP0CG33 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GOLGA6DP0CG33 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GOLGA6DP0CG33 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GOLGA6DP0CG33 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GOLGA6DP0CG33 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GOLGA6DP0CG33 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GOLGA6DP0CG33 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GOLGA6DP0CG33 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GOLGA6DP0CG33 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GOLGA6DP0CG33 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
GOLGA6DP0CG33 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GOLGA6DP0CG33 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GOLGA6DP0CG33 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GOLGA6DP0CG33 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GOLGA6DP0CG33 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GOLGA6DP0CG33 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GOLGA6DP0CG33 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GOLGA6DP0CG33 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GOLGA6DP0CG33 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOLGA6DP0CG33 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOLGA6DP0CG33 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOLGA6DP0CG33 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6DP0CG33 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6DP0CG33 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6DP0CG33 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6DP0CG33 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6DP0CG33 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6DP0CG33 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6DP0CG33 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6DP0CG33 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOLGA6DP0CG33 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOLGA6DP0CG33 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOLGA6DP0CG33 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLGA6DP0CG33 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLGA6DP0CG33 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLGA6DP0CG33 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLGA6DP0CG33 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GOLGA6DP0CG33 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GOLGA6DP0CG33 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA6DP0CG33 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA6DP0CG33 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA6DP0CG33 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA6DP0CG33 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLGA6DP0CG33 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLGA6DP0CG33 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA6DP0CG33 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA6DP0CG33 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA6DP0CG33 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA6DP0CG33 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA6DP0CG33 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA6DP0CG33 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA6DP0CG33 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA6DP0CG33 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA6DP0CG33 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLGA6DP0CG33 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLGA6DP0CG33 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLGA6DP0CG33 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLGA6DP0CG33 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLGA6DP0CG33 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLGA6DP0CG33 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLGA6DP0CG33 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLGA6DP0CG33 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLGA6DP0CG33 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLGA6DP0CG33 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLGA6DP0CG33 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GOLGA6DP0CG33 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GOLGA6DP0CG33 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GOLGA6DP0CG33 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GOLGA6DP0CG33 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GOLGA6DP0CG33 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GOLGA6DP0CG33 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GOLGA6DP0CG33 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GOLGA6DP0CG33 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GOLGA6DP0CG33 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6DP0CG33 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6DP0CG33 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6DP0CG33 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6DP0CG33 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6DP0CG33 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6DP0CG33 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6DP0CG33 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6DP0CG33 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6DP0CG33 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GOLGA6DP0CG33 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GOLGA6DP0CG33 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GOLGA6DP0CG33 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GOLGA6DP0CG33 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
GOLGA6DP0CG33 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GOLGA6DP0CG33 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
GOLGA6DP0CG33 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms