Protein–RNA interactions for Protein: P0C6S8

LINGO3, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO3P0C6S8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINGO3P0C6S8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINGO3P0C6S8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINGO3P0C6S8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINGO3P0C6S8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINGO3P0C6S8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINGO3P0C6S8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINGO3P0C6S8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINGO3P0C6S8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINGO3P0C6S8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINGO3P0C6S8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINGO3P0C6S8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINGO3P0C6S8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINGO3P0C6S8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINGO3P0C6S8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINGO3P0C6S8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINGO3P0C6S8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LINGO3P0C6S8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINGO3P0C6S8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINGO3P0C6S8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINGO3P0C6S8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINGO3P0C6S8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINGO3P0C6S8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINGO3P0C6S8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LINGO3P0C6S8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINGO3P0C6S8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINGO3P0C6S8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINGO3P0C6S8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINGO3P0C6S8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINGO3P0C6S8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINGO3P0C6S8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINGO3P0C6S8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINGO3P0C6S8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINGO3P0C6S8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINGO3P0C6S8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINGO3P0C6S8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINGO3P0C6S8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINGO3P0C6S8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINGO3P0C6S8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINGO3P0C6S8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINGO3P0C6S8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINGO3P0C6S8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINGO3P0C6S8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LINGO3P0C6S8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LINGO3P0C6S8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
LINGO3P0C6S8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LINGO3P0C6S8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LINGO3P0C6S8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINGO3P0C6S8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINGO3P0C6S8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINGO3P0C6S8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINGO3P0C6S8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINGO3P0C6S8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINGO3P0C6S8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINGO3P0C6S8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINGO3P0C6S8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINGO3P0C6S8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINGO3P0C6S8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINGO3P0C6S8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINGO3P0C6S8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINGO3P0C6S8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINGO3P0C6S8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINGO3P0C6S8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINGO3P0C6S8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINGO3P0C6S8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINGO3P0C6S8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINGO3P0C6S8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINGO3P0C6S8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINGO3P0C6S8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINGO3P0C6S8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LINGO3P0C6S8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINGO3P0C6S8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINGO3P0C6S8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINGO3P0C6S8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINGO3P0C6S8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINGO3P0C6S8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINGO3P0C6S8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINGO3P0C6S8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LINGO3P0C6S8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LINGO3P0C6S8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LINGO3P0C6S8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINGO3P0C6S8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINGO3P0C6S8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINGO3P0C6S8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINGO3P0C6S8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINGO3P0C6S8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINGO3P0C6S8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINGO3P0C6S8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINGO3P0C6S8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINGO3P0C6S8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINGO3P0C6S8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINGO3P0C6S8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINGO3P0C6S8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINGO3P0C6S8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINGO3P0C6S8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINGO3P0C6S8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINGO3P0C6S8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINGO3P0C6S8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINGO3P0C6S8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINGO3P0C6S8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms