Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRPRAP08240 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRPRAP08240 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRPRAP08240 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SRPRAP08240 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SRPRAP08240 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRPRAP08240 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRPRAP08240 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRPRAP08240 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRPRAP08240 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRPRAP08240 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SRPRAP08240 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRPRAP08240 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRPRAP08240 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRPRAP08240 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRPRAP08240 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRPRAP08240 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SRPRAP08240 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRPRAP08240 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRPRAP08240 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRPRAP08240 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRPRAP08240 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRPRAP08240 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRPRAP08240 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRPRAP08240 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRPRAP08240 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRPRAP08240 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRPRAP08240 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRPRAP08240 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRPRAP08240 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRPRAP08240 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SRPRAP08240 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRPRAP08240 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRPRAP08240 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRPRAP08240 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRPRAP08240 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRPRAP08240 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRPRAP08240 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRPRAP08240 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRPRAP08240 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRPRAP08240 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRPRAP08240 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRPRAP08240 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRPRAP08240 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRPRAP08240 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRPRAP08240 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SRPRAP08240 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRPRAP08240 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SRPRAP08240 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRPRAP08240 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRPRAP08240 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRPRAP08240 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRPRAP08240 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRPRAP08240 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SRPRAP08240 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRPRAP08240 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRPRAP08240 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRPRAP08240 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRPRAP08240 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRPRAP08240 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRPRAP08240 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRPRAP08240 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRPRAP08240 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRPRAP08240 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRPRAP08240 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SRPRAP08240 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRPRAP08240 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRPRAP08240 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRPRAP08240 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRPRAP08240 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRPRAP08240 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRPRAP08240 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRPRAP08240 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SRPRAP08240 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRPRAP08240 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRPRAP08240 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRPRAP08240 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SRPRAP08240 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRPRAP08240 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRPRAP08240 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRPRAP08240 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRPRAP08240 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRPRAP08240 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRPRAP08240 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SRPRAP08240 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SRPRAP08240 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SRPRAP08240 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRPRAP08240 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRPRAP08240 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRPRAP08240 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SRPRAP08240 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRPRAP08240 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRPRAP08240 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRPRAP08240 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRPRAP08240 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRPRAP08240 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRPRAP08240 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRPRAP08240 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRPRAP08240 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SRPRAP08240 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms