Protein–RNA interactions for Protein: P07992

ERCC1, DNA excision repair protein ERCC-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC1P07992 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC1P07992 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC1P07992 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC1P07992 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC1P07992 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC1P07992 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC1P07992 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC1P07992 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC1P07992 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC1P07992 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ERCC1P07992 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ERCC1P07992 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC1P07992 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC1P07992 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC1P07992 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC1P07992 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC1P07992 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC1P07992 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC1P07992 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC1P07992 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC1P07992 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC1P07992 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC1P07992 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERCC1P07992 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC1P07992 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC1P07992 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC1P07992 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERCC1P07992 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC1P07992 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC1P07992 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC1P07992 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC1P07992 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC1P07992 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC1P07992 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC1P07992 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERCC1P07992 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC1P07992 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC1P07992 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC1P07992 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC1P07992 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC1P07992 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC1P07992 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC1P07992 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC1P07992 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC1P07992 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ERCC1P07992 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC1P07992 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC1P07992 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC1P07992 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC1P07992 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC1P07992 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC1P07992 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC1P07992 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC1P07992 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC1P07992 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC1P07992 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC1P07992 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC1P07992 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC1P07992 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC1P07992 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC1P07992 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC1P07992 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC1P07992 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC1P07992 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC1P07992 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC1P07992 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC1P07992 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC1P07992 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC1P07992 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC1P07992 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC1P07992 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC1P07992 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC1P07992 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC1P07992 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC1P07992 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC1P07992 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC1P07992 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERCC1P07992 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERCC1P07992 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERCC1P07992 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms