Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTMAP06454 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTMAP06454 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTMAP06454 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PTMAP06454 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTMAP06454 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTMAP06454 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PTMAP06454 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTMAP06454 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTMAP06454 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTMAP06454 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTMAP06454 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTMAP06454 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTMAP06454 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTMAP06454 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTMAP06454 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTMAP06454 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTMAP06454 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTMAP06454 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTMAP06454 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTMAP06454 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTMAP06454 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTMAP06454 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTMAP06454 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTMAP06454 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTMAP06454 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTMAP06454 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTMAP06454 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PTMAP06454 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTMAP06454 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTMAP06454 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTMAP06454 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTMAP06454 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTMAP06454 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTMAP06454 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTMAP06454 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTMAP06454 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTMAP06454 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTMAP06454 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTMAP06454 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTMAP06454 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTMAP06454 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTMAP06454 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTMAP06454 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTMAP06454 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTMAP06454 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTMAP06454 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTMAP06454 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTMAP06454 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTMAP06454 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTMAP06454 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTMAP06454 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTMAP06454 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTMAP06454 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTMAP06454 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTMAP06454 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTMAP06454 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTMAP06454 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTMAP06454 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTMAP06454 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PTMAP06454 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PTMAP06454 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTMAP06454 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTMAP06454 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTMAP06454 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTMAP06454 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTMAP06454 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTMAP06454 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTMAP06454 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTMAP06454 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTMAP06454 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTMAP06454 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTMAP06454 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PTMAP06454 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTMAP06454 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PTMAP06454 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTMAP06454 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTMAP06454 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTMAP06454 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTMAP06454 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTMAP06454 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTMAP06454 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTMAP06454 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTMAP06454 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTMAP06454 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PTMAP06454 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTMAP06454 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTMAP06454 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTMAP06454 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTMAP06454 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
PTMAP06454 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTMAP06454 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTMAP06454 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTMAP06454 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTMAP06454 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTMAP06454 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTMAP06454 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PTMAP06454 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTMAP06454 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTMAP06454 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms