Protein–RNA interactions for Protein: P05787

KRT8, Keratin, type II cytoskeletal 8, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT8P05787 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT8P05787 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT8P05787 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT8P05787 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT8P05787 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT8P05787 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT8P05787 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT8P05787 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT8P05787 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT8P05787 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT8P05787 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT8P05787 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT8P05787 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT8P05787 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT8P05787 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT8P05787 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT8P05787 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT8P05787 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT8P05787 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT8P05787 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT8P05787 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT8P05787 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT8P05787 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT8P05787 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT8P05787 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT8P05787 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT8P05787 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT8P05787 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT8P05787 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT8P05787 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT8P05787 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT8P05787 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT8P05787 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT8P05787 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT8P05787 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT8P05787 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT8P05787 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT8P05787 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT8P05787 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT8P05787 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT8P05787 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT8P05787 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT8P05787 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT8P05787 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT8P05787 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT8P05787 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT8P05787 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT8P05787 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT8P05787 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT8P05787 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT8P05787 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT8P05787 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT8P05787 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT8P05787 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT8P05787 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT8P05787 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT8P05787 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT8P05787 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT8P05787 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT8P05787 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT8P05787 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT8P05787 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT8P05787 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT8P05787 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT8P05787 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT8P05787 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT8P05787 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT8P05787 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT8P05787 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT8P05787 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT8P05787 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT8P05787 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT8P05787 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT8P05787 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT8P05787 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT8P05787 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT8P05787 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT8P05787 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT8P05787 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT8P05787 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT8P05787 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT8P05787 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT8P05787 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT8P05787 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT8P05787 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KRT8P05787 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT8P05787 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT8P05787 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRT8P05787 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT8P05787 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT8P05787 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT8P05787 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRT8P05787 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT8P05787 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT8P05787 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT8P05787 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRT8P05787 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT8P05787 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT8P05787 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT8P05787 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms