Protein–RNA interactions for Protein: P05387

RPLP2, 60S acidic ribosomal protein P2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPLP2P05387 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPLP2P05387 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RPLP2P05387 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPLP2P05387 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPLP2P05387 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPLP2P05387 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPLP2P05387 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPLP2P05387 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPLP2P05387 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPLP2P05387 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RPLP2P05387 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPLP2P05387 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPLP2P05387 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RPLP2P05387 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPLP2P05387 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RPLP2P05387 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPLP2P05387 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPLP2P05387 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPLP2P05387 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPLP2P05387 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPLP2P05387 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPLP2P05387 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPLP2P05387 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPLP2P05387 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPLP2P05387 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPLP2P05387 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPLP2P05387 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPLP2P05387 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RPLP2P05387 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RPLP2P05387 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPLP2P05387 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPLP2P05387 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPLP2P05387 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPLP2P05387 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPLP2P05387 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPLP2P05387 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPLP2P05387 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPLP2P05387 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPLP2P05387 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPLP2P05387 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPLP2P05387 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPLP2P05387 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPLP2P05387 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RPLP2P05387 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPLP2P05387 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPLP2P05387 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPLP2P05387 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPLP2P05387 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RPLP2P05387 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPLP2P05387 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPLP2P05387 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPLP2P05387 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPLP2P05387 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPLP2P05387 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPLP2P05387 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPLP2P05387 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RPLP2P05387 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPLP2P05387 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPLP2P05387 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPLP2P05387 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPLP2P05387 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPLP2P05387 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPLP2P05387 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPLP2P05387 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPLP2P05387 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPLP2P05387 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPLP2P05387 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPLP2P05387 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPLP2P05387 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPLP2P05387 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPLP2P05387 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPLP2P05387 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPLP2P05387 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPLP2P05387 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPLP2P05387 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPLP2P05387 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPLP2P05387 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPLP2P05387 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPLP2P05387 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPLP2P05387 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPLP2P05387 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPLP2P05387 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPLP2P05387 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPLP2P05387 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPLP2P05387 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPLP2P05387 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPLP2P05387 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPLP2P05387 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPLP2P05387 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RPLP2P05387 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPLP2P05387 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPLP2P05387 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPLP2P05387 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPLP2P05387 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPLP2P05387 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPLP2P05387 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPLP2P05387 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPLP2P05387 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RPLP2P05387 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPLP2P05387 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms