Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFNA4P05014 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFNA4P05014 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFNA4P05014 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFNA4P05014 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFNA4P05014 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFNA4P05014 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFNA4P05014 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFNA4P05014 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFNA4P05014 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFNA4P05014 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFNA4P05014 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNA4P05014 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNA4P05014 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNA4P05014 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFNA4P05014 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFNA4P05014 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IFNA4P05014 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IFNA4P05014 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IFNA4P05014 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IFNA4P05014 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNA4P05014 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNA4P05014 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNA4P05014 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNA4P05014 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNA4P05014 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IFNA4P05014 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFNA4P05014 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFNA4P05014 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFNA4P05014 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IFNA4P05014 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFNA4P05014 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFNA4P05014 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFNA4P05014 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
IFNA4P05014 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFNA4P05014 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFNA4P05014 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFNA4P05014 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFNA4P05014 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFNA4P05014 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IFNA4P05014 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFNA4P05014 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
IFNA4P05014 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFNA4P05014 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFNA4P05014 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFNA4P05014 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFNA4P05014 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFNA4P05014 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFNA4P05014 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFNA4P05014 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFNA4P05014 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFNA4P05014 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFNA4P05014 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFNA4P05014 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFNA4P05014 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFNA4P05014 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFNA4P05014 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFNA4P05014 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFNA4P05014 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFNA4P05014 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFNA4P05014 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFNA4P05014 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFNA4P05014 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFNA4P05014 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFNA4P05014 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFNA4P05014 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFNA4P05014 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFNA4P05014 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFNA4P05014 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFNA4P05014 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFNA4P05014 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFNA4P05014 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFNA4P05014 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFNA4P05014 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFNA4P05014 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFNA4P05014 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFNA4P05014 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFNA4P05014 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFNA4P05014 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFNA4P05014 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
IFNA4P05014 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFNA4P05014 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IFNA4P05014 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNA4P05014 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNA4P05014 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNA4P05014 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNA4P05014 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNA4P05014 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IFNA4P05014 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFNA4P05014 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFNA4P05014 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFNA4P05014 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IFNA4P05014 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IFNA4P05014 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms