Protein–RNA interactions for Protein: P04440

HLA-DPB1, HLA class II histocompatibility antigen, DP beta 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPB1P04440 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HLA-DPB1P04440 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-DPB1P04440 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-DPB1P04440 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-DPB1P04440 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-DPB1P04440 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HLA-DPB1P04440 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
HLA-DPB1P04440 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-DPB1P04440 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-DPB1P04440 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-DPB1P04440 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-DPB1P04440 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-DPB1P04440 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-DPB1P04440 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-DPB1P04440 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DPB1P04440 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DPB1P04440 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DPB1P04440 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DPB1P04440 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DPB1P04440 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DPB1P04440 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DPB1P04440 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DPB1P04440 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-DPB1P04440 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-DPB1P04440 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-DPB1P04440 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DPB1P04440 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DPB1P04440 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DPB1P04440 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DPB1P04440 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DPB1P04440 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DPB1P04440 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DPB1P04440 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-DPB1P04440 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-DPB1P04440 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-DPB1P04440 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-DPB1P04440 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-DPB1P04440 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-DPB1P04440 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HLA-DPB1P04440 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HLA-DPB1P04440 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-DPB1P04440 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-DPB1P04440 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-DPB1P04440 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-DPB1P04440 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-DPB1P04440 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-DPB1P04440 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-DPB1P04440 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-DPB1P04440 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-DPB1P04440 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DPB1P04440 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DPB1P04440 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DPB1P04440 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DPB1P04440 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DPB1P04440 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-DPB1P04440 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-DPB1P04440 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-DPB1P04440 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-DPB1P04440 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-DPB1P04440 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-DPB1P04440 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-DPB1P04440 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-DPB1P04440 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HLA-DPB1P04440 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
HLA-DPB1P04440 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DPB1P04440 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DPB1P04440 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DPB1P04440 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DPB1P04440 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DPB1P04440 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DPB1P04440 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DPB1P04440 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DPB1P04440 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DPB1P04440 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DPB1P04440 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DPB1P04440 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DPB1P04440 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DPB1P04440 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DPB1P04440 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DPB1P04440 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DPB1P04440 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DPB1P04440 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DPB1P04440 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DPB1P04440 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DPB1P04440 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DPB1P04440 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DPB1P04440 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DPB1P04440 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DPB1P04440 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DPB1P04440 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DPB1P04440 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DPB1P04440 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DPB1P04440 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DPB1P04440 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DPB1P04440 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DPB1P04440 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-DPB1P04440 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-DPB1P04440 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-DPB1P04440 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-DPB1P04440 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms