Protein–RNA interactions for Protein: P03891

MT-ND2, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND2P03891 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MT-ND2P03891 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MT-ND2P03891 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MT-ND2P03891 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MT-ND2P03891 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MT-ND2P03891 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MT-ND2P03891 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MT-ND2P03891 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MT-ND2P03891 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MT-ND2P03891 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MT-ND2P03891 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MT-ND2P03891 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MT-ND2P03891 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MT-ND2P03891 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MT-ND2P03891 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MT-ND2P03891 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MT-ND2P03891 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MT-ND2P03891 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MT-ND2P03891 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-ND2P03891 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-ND2P03891 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MT-ND2P03891 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MT-ND2P03891 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MT-ND2P03891 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MT-ND2P03891 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MT-ND2P03891 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MT-ND2P03891 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MT-ND2P03891 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MT-ND2P03891 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MT-ND2P03891 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MT-ND2P03891 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MT-ND2P03891 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MT-ND2P03891 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MT-ND2P03891 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-ND2P03891 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-ND2P03891 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-ND2P03891 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-ND2P03891 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-ND2P03891 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-ND2P03891 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MT-ND2P03891 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MT-ND2P03891 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MT-ND2P03891 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MT-ND2P03891 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MT-ND2P03891 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MT-ND2P03891 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MT-ND2P03891 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MT-ND2P03891 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MT-ND2P03891 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MT-ND2P03891 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MT-ND2P03891 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MT-ND2P03891 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MT-ND2P03891 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MT-ND2P03891 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MT-ND2P03891 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MT-ND2P03891 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MT-ND2P03891 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MT-ND2P03891 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MT-ND2P03891 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MT-ND2P03891 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MT-ND2P03891 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MT-ND2P03891 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MT-ND2P03891 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MT-ND2P03891 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MT-ND2P03891 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MT-ND2P03891 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MT-ND2P03891 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MT-ND2P03891 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MT-ND2P03891 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MT-ND2P03891 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MT-ND2P03891 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MT-ND2P03891 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MT-ND2P03891 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MT-ND2P03891 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MT-ND2P03891 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MT-ND2P03891 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MT-ND2P03891 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MT-ND2P03891 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MT-ND2P03891 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MT-ND2P03891 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MT-ND2P03891 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MT-ND2P03891 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MT-ND2P03891 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MT-ND2P03891 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MT-ND2P03891 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MT-ND2P03891 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MT-ND2P03891 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MT-ND2P03891 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MT-ND2P03891 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-ND2P03891 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MT-ND2P03891 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MT-ND2P03891 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MT-ND2P03891 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MT-ND2P03891 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MT-ND2P03891 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MT-ND2P03891 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MT-ND2P03891 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MT-ND2P03891 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MT-ND2P03891 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MT-ND2P03891 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms