Protein–RNA interactions for Protein: P03372

ESR1, Estrogen receptor, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESR1P03372 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ESR1P03372 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ESR1P03372 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ESR1P03372 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ESR1P03372 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ESR1P03372 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ESR1P03372 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ESR1P03372 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ESR1P03372 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ESR1P03372 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ESR1P03372 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ESR1P03372 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ESR1P03372 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ESR1P03372 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ESR1P03372 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ESR1P03372 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ESR1P03372 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ESR1P03372 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ESR1P03372 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ESR1P03372 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ESR1P03372 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ESR1P03372 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ESR1P03372 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ESR1P03372 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ESR1P03372 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ESR1P03372 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ESR1P03372 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ESR1P03372 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ESR1P03372 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ESR1P03372 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ESR1P03372 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ESR1P03372 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ESR1P03372 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ESR1P03372 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ESR1P03372 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ESR1P03372 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ESR1P03372 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ESR1P03372 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ESR1P03372 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ESR1P03372 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ESR1P03372 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ESR1P03372 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ESR1P03372 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ESR1P03372 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ESR1P03372 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ESR1P03372 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ESR1P03372 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ESR1P03372 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ESR1P03372 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ESR1P03372 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ESR1P03372 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ESR1P03372 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ESR1P03372 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ESR1P03372 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ESR1P03372 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ESR1P03372 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ESR1P03372 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ESR1P03372 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ESR1P03372 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ESR1P03372 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ESR1P03372 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ESR1P03372 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ESR1P03372 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ESR1P03372 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ESR1P03372 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ESR1P03372 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ESR1P03372 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ESR1P03372 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ESR1P03372 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ESR1P03372 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ESR1P03372 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ESR1P03372 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ESR1P03372 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ESR1P03372 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ESR1P03372 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ESR1P03372 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ESR1P03372 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ESR1P03372 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ESR1P03372 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ESR1P03372 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ESR1P03372 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ESR1P03372 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ESR1P03372 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ESR1P03372 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ESR1P03372 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ESR1P03372 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ESR1P03372 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ESR1P03372 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ESR1P03372 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ESR1P03372 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ESR1P03372 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ESR1P03372 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ESR1P03372 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ESR1P03372 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ESR1P03372 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ESR1P03372 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ESR1P03372 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ESR1P03372 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ESR1P03372 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ESR1P03372 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms