Protein–RNA interactions for Protein: P01718

IGLV3-27, Immunoglobulin lambda variable 3-27, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGLV3-27P01718 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGLV3-27P01718 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGLV3-27P01718 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGLV3-27P01718 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGLV3-27P01718 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGLV3-27P01718 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGLV3-27P01718 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGLV3-27P01718 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGLV3-27P01718 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGLV3-27P01718 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGLV3-27P01718 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGLV3-27P01718 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGLV3-27P01718 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGLV3-27P01718 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGLV3-27P01718 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
IGLV3-27P01718 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGLV3-27P01718 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGLV3-27P01718 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGLV3-27P01718 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
IGLV3-27P01718 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGLV3-27P01718 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGLV3-27P01718 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGLV3-27P01718 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGLV3-27P01718 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGLV3-27P01718 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGLV3-27P01718 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGLV3-27P01718 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGLV3-27P01718 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGLV3-27P01718 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGLV3-27P01718 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGLV3-27P01718 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGLV3-27P01718 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGLV3-27P01718 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGLV3-27P01718 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGLV3-27P01718 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGLV3-27P01718 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IGLV3-27P01718 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IGLV3-27P01718 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IGLV3-27P01718 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IGLV3-27P01718 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IGLV3-27P01718 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IGLV3-27P01718 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IGLV3-27P01718 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
IGLV3-27P01718 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
IGLV3-27P01718 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IGLV3-27P01718 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IGLV3-27P01718 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IGLV3-27P01718 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IGLV3-27P01718 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
IGLV3-27P01718 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
IGLV3-27P01718 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IGLV3-27P01718 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
IGLV3-27P01718 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IGLV3-27P01718 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IGLV3-27P01718 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IGLV3-27P01718 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IGLV3-27P01718 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IGLV3-27P01718 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
IGLV3-27P01718 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IGLV3-27P01718 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IGLV3-27P01718 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IGLV3-27P01718 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IGLV3-27P01718 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IGLV3-27P01718 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IGLV3-27P01718 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IGLV3-27P01718 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IGLV3-27P01718 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
IGLV3-27P01718 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IGLV3-27P01718 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IGLV3-27P01718 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IGLV3-27P01718 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IGLV3-27P01718 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IGLV3-27P01718 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IGLV3-27P01718 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IGLV3-27P01718 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IGLV3-27P01718 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGLV3-27P01718 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGLV3-27P01718 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGLV3-27P01718 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGLV3-27P01718 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGLV3-27P01718 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGLV3-27P01718 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGLV3-27P01718 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IGLV3-27P01718 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGLV3-27P01718 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGLV3-27P01718 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGLV3-27P01718 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IGLV3-27P01718 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IGLV3-27P01718 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IGLV3-27P01718 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IGLV3-27P01718 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
IGLV3-27P01718 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
IGLV3-27P01718 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IGLV3-27P01718 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IGLV3-27P01718 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IGLV3-27P01718 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IGLV3-27P01718 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IGLV3-27P01718 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
IGLV3-27P01718 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IGLV3-27P01718 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms