Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
MBD3O95983 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MBD3O95983 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MBD3O95983 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MBD3O95983 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MBD3O95983 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MBD3O95983 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MBD3O95983 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MBD3O95983 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MBD3O95983 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MBD3O95983 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MBD3O95983 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MBD3O95983 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MBD3O95983 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MBD3O95983 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MBD3O95983 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MBD3O95983 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MBD3O95983 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MBD3O95983 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MBD3O95983 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MBD3O95983 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MBD3O95983 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MBD3O95983 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MBD3O95983 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MBD3O95983 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MBD3O95983 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MBD3O95983 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MBD3O95983 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MBD3O95983 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MBD3O95983 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MBD3O95983 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MBD3O95983 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MBD3O95983 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MBD3O95983 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MBD3O95983 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MBD3O95983 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MBD3O95983 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MBD3O95983 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MBD3O95983 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MBD3O95983 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MBD3O95983 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MBD3O95983 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MBD3O95983 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MBD3O95983 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MBD3O95983 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MBD3O95983 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MBD3O95983 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
MBD3O95983 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
MBD3O95983 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MBD3O95983 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MBD3O95983 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MBD3O95983 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
MBD3O95983 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MBD3O95983 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MBD3O95983 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MBD3O95983 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MBD3O95983 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MBD3O95983 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MBD3O95983 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MBD3O95983 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MBD3O95983 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MBD3O95983 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MBD3O95983 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MBD3O95983 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MBD3O95983 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MBD3O95983 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MBD3O95983 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
MBD3O95983 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MBD3O95983 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MBD3O95983 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MBD3O95983 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
MBD3O95983 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MBD3O95983 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MBD3O95983 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MBD3O95983 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MBD3O95983 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MBD3O95983 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MBD3O95983 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MBD3O95983 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MBD3O95983 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MBD3O95983 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MBD3O95983 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MBD3O95983 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MBD3O95983 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MBD3O95983 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MBD3O95983 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MBD3O95983 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MBD3O95983 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MBD3O95983 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MBD3O95983 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MBD3O95983 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MBD3O95983 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MBD3O95983 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MBD3O95983 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MBD3O95983 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MBD3O95983 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MBD3O95983 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MBD3O95983 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MBD3O95983 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MBD3O95983 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms