Protein–RNA interactions for Protein: O95832

CLDN1, Claudin-1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN1O95832 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN1O95832 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN1O95832 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN1O95832 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN1O95832 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN1O95832 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN1O95832 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN1O95832 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN1O95832 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN1O95832 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN1O95832 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN1O95832 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN1O95832 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN1O95832 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN1O95832 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN1O95832 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN1O95832 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN1O95832 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN1O95832 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN1O95832 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN1O95832 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN1O95832 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN1O95832 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN1O95832 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN1O95832 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN1O95832 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN1O95832 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN1O95832 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN1O95832 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN1O95832 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN1O95832 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN1O95832 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN1O95832 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN1O95832 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN1O95832 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN1O95832 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN1O95832 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN1O95832 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN1O95832 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN1O95832 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN1O95832 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN1O95832 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN1O95832 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN1O95832 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN1O95832 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN1O95832 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN1O95832 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN1O95832 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN1O95832 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN1O95832 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLDN1O95832 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN1O95832 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN1O95832 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN1O95832 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN1O95832 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN1O95832 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN1O95832 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN1O95832 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLDN1O95832 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN1O95832 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLDN1O95832 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN1O95832 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN1O95832 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN1O95832 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN1O95832 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN1O95832 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLDN1O95832 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN1O95832 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN1O95832 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN1O95832 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN1O95832 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN1O95832 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN1O95832 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN1O95832 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN1O95832 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN1O95832 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN1O95832 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN1O95832 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN1O95832 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN1O95832 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN1O95832 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN1O95832 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN1O95832 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN1O95832 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN1O95832 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN1O95832 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN1O95832 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN1O95832 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN1O95832 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN1O95832 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN1O95832 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN1O95832 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN1O95832 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN1O95832 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN1O95832 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN1O95832 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN1O95832 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN1O95832 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN1O95832 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN1O95832 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms