Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEC24AO95486 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEC24AO95486 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEC24AO95486 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEC24AO95486 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEC24AO95486 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEC24AO95486 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEC24AO95486 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEC24AO95486 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEC24AO95486 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEC24AO95486 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEC24AO95486 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SEC24AO95486 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEC24AO95486 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEC24AO95486 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEC24AO95486 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEC24AO95486 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEC24AO95486 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEC24AO95486 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEC24AO95486 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEC24AO95486 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEC24AO95486 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEC24AO95486 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEC24AO95486 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEC24AO95486 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEC24AO95486 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEC24AO95486 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEC24AO95486 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEC24AO95486 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEC24AO95486 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEC24AO95486 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEC24AO95486 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SEC24AO95486 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEC24AO95486 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC24AO95486 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC24AO95486 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC24AO95486 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEC24AO95486 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SEC24AO95486 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC24AO95486 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC24AO95486 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC24AO95486 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC24AO95486 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC24AO95486 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC24AO95486 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC24AO95486 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC24AO95486 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC24AO95486 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC24AO95486 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEC24AO95486 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEC24AO95486 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEC24AO95486 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC24AO95486 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC24AO95486 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC24AO95486 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC24AO95486 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEC24AO95486 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEC24AO95486 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEC24AO95486 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SEC24AO95486 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEC24AO95486 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEC24AO95486 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEC24AO95486 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEC24AO95486 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEC24AO95486 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEC24AO95486 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC24AO95486 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC24AO95486 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEC24AO95486 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEC24AO95486 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEC24AO95486 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEC24AO95486 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEC24AO95486 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEC24AO95486 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEC24AO95486 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEC24AO95486 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEC24AO95486 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC24AO95486 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC24AO95486 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEC24AO95486 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEC24AO95486 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEC24AO95486 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEC24AO95486 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEC24AO95486 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEC24AO95486 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SEC24AO95486 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEC24AO95486 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEC24AO95486 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEC24AO95486 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEC24AO95486 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEC24AO95486 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEC24AO95486 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SEC24AO95486 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SEC24AO95486 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEC24AO95486 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEC24AO95486 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEC24AO95486 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC24AO95486 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC24AO95486 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC24AO95486 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms