Protein–RNA interactions for Protein: O94868

FCHSD2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHSD2O94868 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
FCHSD2O94868 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
FCHSD2O94868 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
FCHSD2O94868 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
FCHSD2O94868 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
FCHSD2O94868 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
FCHSD2O94868 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
FCHSD2O94868 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
FCHSD2O94868 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.81■■■■□ 3
FCHSD2O94868 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
FCHSD2O94868 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
FCHSD2O94868 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
FCHSD2O94868 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
FCHSD2O94868 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
FCHSD2O94868 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
FCHSD2O94868 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
FCHSD2O94868 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
FCHSD2O94868 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
FCHSD2O94868 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
FCHSD2O94868 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
FCHSD2O94868 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
FCHSD2O94868 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
FCHSD2O94868 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
FCHSD2O94868 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
FCHSD2O94868 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
FCHSD2O94868 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
FCHSD2O94868 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
FCHSD2O94868 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
FCHSD2O94868 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
FCHSD2O94868 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
FCHSD2O94868 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
FCHSD2O94868 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
FCHSD2O94868 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
FCHSD2O94868 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
FCHSD2O94868 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
FCHSD2O94868 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
FCHSD2O94868 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
FCHSD2O94868 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
FCHSD2O94868 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
FCHSD2O94868 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
FCHSD2O94868 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
FCHSD2O94868 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
FCHSD2O94868 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
FCHSD2O94868 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
FCHSD2O94868 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
FCHSD2O94868 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
FCHSD2O94868 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
FCHSD2O94868 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
FCHSD2O94868 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
FCHSD2O94868 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
FCHSD2O94868 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
FCHSD2O94868 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
FCHSD2O94868 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
FCHSD2O94868 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
FCHSD2O94868 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
FCHSD2O94868 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
FCHSD2O94868 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
FCHSD2O94868 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
FCHSD2O94868 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
FCHSD2O94868 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
FCHSD2O94868 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
FCHSD2O94868 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
FCHSD2O94868 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
FCHSD2O94868 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
FCHSD2O94868 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
FCHSD2O94868 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
FCHSD2O94868 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
FCHSD2O94868 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
FCHSD2O94868 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
FCHSD2O94868 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
FCHSD2O94868 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
FCHSD2O94868 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
FCHSD2O94868 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
FCHSD2O94868 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
FCHSD2O94868 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
FCHSD2O94868 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
FCHSD2O94868 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
FCHSD2O94868 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
FCHSD2O94868 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
FCHSD2O94868 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
FCHSD2O94868 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
FCHSD2O94868 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
FCHSD2O94868 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
FCHSD2O94868 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
FCHSD2O94868 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
FCHSD2O94868 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
FCHSD2O94868 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
FCHSD2O94868 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
FCHSD2O94868 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
FCHSD2O94868 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
FCHSD2O94868 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
FCHSD2O94868 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
FCHSD2O94868 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
FCHSD2O94868 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
FCHSD2O94868 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
FCHSD2O94868 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
FCHSD2O94868 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
FCHSD2O94868 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
FCHSD2O94868 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
FCHSD2O94868 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms