Protein–RNA interactions for Protein: O76090

BEST1, Bestrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST1O76090 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BEST1O76090 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BEST1O76090 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BEST1O76090 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BEST1O76090 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
BEST1O76090 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BEST1O76090 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BEST1O76090 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BEST1O76090 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BEST1O76090 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BEST1O76090 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BEST1O76090 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BEST1O76090 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BEST1O76090 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BEST1O76090 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BEST1O76090 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
BEST1O76090 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BEST1O76090 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BEST1O76090 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BEST1O76090 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BEST1O76090 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BEST1O76090 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BEST1O76090 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BEST1O76090 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BEST1O76090 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BEST1O76090 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BEST1O76090 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BEST1O76090 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BEST1O76090 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BEST1O76090 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BEST1O76090 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BEST1O76090 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BEST1O76090 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BEST1O76090 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BEST1O76090 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BEST1O76090 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BEST1O76090 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BEST1O76090 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BEST1O76090 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BEST1O76090 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BEST1O76090 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BEST1O76090 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BEST1O76090 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BEST1O76090 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BEST1O76090 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BEST1O76090 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BEST1O76090 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BEST1O76090 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BEST1O76090 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BEST1O76090 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BEST1O76090 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BEST1O76090 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BEST1O76090 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BEST1O76090 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BEST1O76090 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BEST1O76090 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BEST1O76090 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BEST1O76090 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BEST1O76090 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BEST1O76090 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BEST1O76090 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BEST1O76090 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BEST1O76090 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BEST1O76090 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BEST1O76090 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BEST1O76090 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BEST1O76090 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BEST1O76090 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BEST1O76090 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BEST1O76090 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BEST1O76090 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
BEST1O76090 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BEST1O76090 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BEST1O76090 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BEST1O76090 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BEST1O76090 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
BEST1O76090 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BEST1O76090 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BEST1O76090 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BEST1O76090 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BEST1O76090 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BEST1O76090 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BEST1O76090 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BEST1O76090 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BEST1O76090 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BEST1O76090 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BEST1O76090 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BEST1O76090 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BEST1O76090 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BEST1O76090 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BEST1O76090 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BEST1O76090 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BEST1O76090 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BEST1O76090 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BEST1O76090 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BEST1O76090 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BEST1O76090 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BEST1O76090 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BEST1O76090 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BEST1O76090 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms