Protein–RNA interactions for Protein: O75956

CDK2AP2, Cyclin-dependent kinase 2-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2AP2O75956 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK2AP2O75956 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK2AP2O75956 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK2AP2O75956 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK2AP2O75956 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK2AP2O75956 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK2AP2O75956 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK2AP2O75956 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK2AP2O75956 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK2AP2O75956 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK2AP2O75956 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK2AP2O75956 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK2AP2O75956 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK2AP2O75956 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK2AP2O75956 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK2AP2O75956 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK2AP2O75956 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK2AP2O75956 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK2AP2O75956 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK2AP2O75956 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK2AP2O75956 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK2AP2O75956 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK2AP2O75956 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK2AP2O75956 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK2AP2O75956 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK2AP2O75956 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK2AP2O75956 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK2AP2O75956 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK2AP2O75956 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK2AP2O75956 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK2AP2O75956 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK2AP2O75956 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CDK2AP2O75956 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK2AP2O75956 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK2AP2O75956 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK2AP2O75956 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK2AP2O75956 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK2AP2O75956 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK2AP2O75956 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK2AP2O75956 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK2AP2O75956 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK2AP2O75956 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK2AP2O75956 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK2AP2O75956 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK2AP2O75956 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK2AP2O75956 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK2AP2O75956 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK2AP2O75956 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDK2AP2O75956 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK2AP2O75956 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK2AP2O75956 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK2AP2O75956 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK2AP2O75956 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK2AP2O75956 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDK2AP2O75956 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK2AP2O75956 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK2AP2O75956 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK2AP2O75956 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK2AP2O75956 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK2AP2O75956 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK2AP2O75956 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK2AP2O75956 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDK2AP2O75956 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK2AP2O75956 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK2AP2O75956 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK2AP2O75956 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK2AP2O75956 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK2AP2O75956 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDK2AP2O75956 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK2AP2O75956 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDK2AP2O75956 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK2AP2O75956 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK2AP2O75956 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK2AP2O75956 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK2AP2O75956 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK2AP2O75956 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK2AP2O75956 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDK2AP2O75956 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK2AP2O75956 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDK2AP2O75956 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK2AP2O75956 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK2AP2O75956 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK2AP2O75956 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK2AP2O75956 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK2AP2O75956 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK2AP2O75956 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK2AP2O75956 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDK2AP2O75956 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK2AP2O75956 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK2AP2O75956 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK2AP2O75956 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK2AP2O75956 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDK2AP2O75956 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK2AP2O75956 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK2AP2O75956 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK2AP2O75956 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK2AP2O75956 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK2AP2O75956 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK2AP2O75956 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK2AP2O75956 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms