Protein–RNA interactions for Protein: O75901

RASSF9, Ras association domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF9O75901 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RASSF9O75901 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RASSF9O75901 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RASSF9O75901 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RASSF9O75901 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASSF9O75901 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASSF9O75901 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASSF9O75901 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASSF9O75901 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASSF9O75901 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RASSF9O75901 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RASSF9O75901 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RASSF9O75901 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RASSF9O75901 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASSF9O75901 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASSF9O75901 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASSF9O75901 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RASSF9O75901 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RASSF9O75901 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RASSF9O75901 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RASSF9O75901 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RASSF9O75901 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RASSF9O75901 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RASSF9O75901 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms