Protein–RNA interactions for Protein: O75901

RASSF9, Ras association domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF9O75901 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RASSF9O75901 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RASSF9O75901 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RASSF9O75901 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RASSF9O75901 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASSF9O75901 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASSF9O75901 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASSF9O75901 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASSF9O75901 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASSF9O75901 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RASSF9O75901 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RASSF9O75901 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RASSF9O75901 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RASSF9O75901 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASSF9O75901 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASSF9O75901 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASSF9O75901 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RASSF9O75901 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RASSF9O75901 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RASSF9O75901 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RASSF9O75901 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RASSF9O75901 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RASSF9O75901 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RASSF9O75901 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RASSF9O75901 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RASSF9O75901 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms