Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NPM3O75607 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NPM3O75607 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NPM3O75607 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NPM3O75607 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NPM3O75607 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NPM3O75607 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NPM3O75607 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NPM3O75607 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NPM3O75607 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NPM3O75607 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NPM3O75607 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NPM3O75607 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NPM3O75607 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NPM3O75607 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
NPM3O75607 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
NPM3O75607 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NPM3O75607 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NPM3O75607 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
NPM3O75607 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NPM3O75607 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NPM3O75607 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NPM3O75607 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NPM3O75607 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NPM3O75607 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NPM3O75607 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NPM3O75607 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
NPM3O75607 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NPM3O75607 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NPM3O75607 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NPM3O75607 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NPM3O75607 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NPM3O75607 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NPM3O75607 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NPM3O75607 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NPM3O75607 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NPM3O75607 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NPM3O75607 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NPM3O75607 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NPM3O75607 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NPM3O75607 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NPM3O75607 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
NPM3O75607 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NPM3O75607 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NPM3O75607 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NPM3O75607 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NPM3O75607 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NPM3O75607 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
NPM3O75607 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NPM3O75607 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NPM3O75607 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
NPM3O75607 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NPM3O75607 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NPM3O75607 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NPM3O75607 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NPM3O75607 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NPM3O75607 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NPM3O75607 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.42
NPM3O75607 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
NPM3O75607 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NPM3O75607 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NPM3O75607 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NPM3O75607 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NPM3O75607 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NPM3O75607 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NPM3O75607 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NPM3O75607 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NPM3O75607 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NPM3O75607 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NPM3O75607 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NPM3O75607 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
NPM3O75607 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NPM3O75607 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NPM3O75607 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NPM3O75607 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NPM3O75607 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NPM3O75607 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NPM3O75607 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NPM3O75607 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NPM3O75607 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NPM3O75607 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NPM3O75607 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
NPM3O75607 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
NPM3O75607 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NPM3O75607 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NPM3O75607 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NPM3O75607 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NPM3O75607 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NPM3O75607 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NPM3O75607 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NPM3O75607 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NPM3O75607 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NPM3O75607 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NPM3O75607 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NPM3O75607 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NPM3O75607 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NPM3O75607 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NPM3O75607 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NPM3O75607 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NPM3O75607 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms