Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA10O75578 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA10O75578 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA10O75578 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA10O75578 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA10O75578 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA10O75578 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA10O75578 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA10O75578 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA10O75578 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA10O75578 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA10O75578 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA10O75578 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA10O75578 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA10O75578 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA10O75578 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA10O75578 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA10O75578 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA10O75578 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA10O75578 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA10O75578 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA10O75578 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA10O75578 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGA10O75578 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA10O75578 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA10O75578 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA10O75578 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA10O75578 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA10O75578 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA10O75578 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA10O75578 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA10O75578 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA10O75578 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA10O75578 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA10O75578 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA10O75578 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA10O75578 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA10O75578 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA10O75578 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA10O75578 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA10O75578 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA10O75578 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA10O75578 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA10O75578 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA10O75578 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA10O75578 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA10O75578 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGA10O75578 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA10O75578 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA10O75578 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA10O75578 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA10O75578 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA10O75578 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA10O75578 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA10O75578 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA10O75578 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA10O75578 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA10O75578 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA10O75578 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA10O75578 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA10O75578 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA10O75578 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA10O75578 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA10O75578 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA10O75578 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA10O75578 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA10O75578 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA10O75578 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA10O75578 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA10O75578 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA10O75578 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA10O75578 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA10O75578 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA10O75578 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA10O75578 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA10O75578 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA10O75578 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA10O75578 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA10O75578 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA10O75578 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA10O75578 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA10O75578 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA10O75578 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA10O75578 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA10O75578 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA10O75578 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA10O75578 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA10O75578 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA10O75578 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA10O75578 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA10O75578 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA10O75578 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA10O75578 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA10O75578 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA10O75578 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA10O75578 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA10O75578 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA10O75578 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA10O75578 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA10O75578 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms