Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.992e-8■■■■■ 256.5
SF3B1O75533 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.058e-15■■■■■ 253.5
SF3B1O75533 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -08e-15■■■■■ 253.5
SF3B1O75533 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.471e-6■■■■■ 252.7
SF3B1O75533 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.451e-6■■■■■ 252.7
SF3B1O75533 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.141e-6■■■■■ 252.7
SF3B1O75533 QARS-249ENST00000637113 1369 ntTSL 517.17■□□□□ 0.345e-7■■■■■ 252.7
SF3B1O75533 QARS-252ENST00000637908 637 ntTSL 516.58■□□□□ 0.245e-7■■■■■ 252.7
SF3B1O75533 QARS-208ENST00000459870 1317 ntTSL 515.19■□□□□ 0.025e-7■■■■■ 252.7
SF3B1O75533 QARS-211ENST00000470113 954 ntTSL 513.36□□□□□ -0.275e-7■■■■■ 252.7
SF3B1O75533 QARS-228ENST00000634432 582 ntTSL 310.84□□□□□ -0.675e-7■■■■■ 252.7
SF3B1O75533 QARS-207ENST00000453392 859 ntTSL 510.43□□□□□ -0.745e-7■■■■■ 252.7
SF3B1O75533 QARS-250ENST00000637281 1327 ntTSL 57.69□□□□□ -1.185e-7■■■■■ 252.7
SF3B1O75533 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.531e-6■■■■■ 252.5
SF3B1O75533 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.483e-8■■■■■ 249.9
SF3B1O75533 SIRT7-210ENST00000572902 909 ntTSL 323.32■■□□□ 1.322e-7■■■■■ 249.9
SF3B1O75533 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.483e-8■■■■■ 249.9
SF3B1O75533 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.483e-8■■■■■ 249.9
SF3B1O75533 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.253e-8■■■■■ 249.9
SF3B1O75533 NOL4L-204ENST00000375677 541 ntTSL 312.85□□□□□ -0.355e-9■■■■■ 248.8
SF3B1O75533 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.081e-6■■■■■ 246.2
SF3B1O75533 NDRG1-224ENST00000522738 530 ntTSL 512.59□□□□□ -0.392e-10■■■■■ 246.2
SF3B1O75533 AC087289.3-202ENST00000593156 4270 ntTSL 212.27□□□□□ -0.443e-9■■■■■ 245.8
SF3B1O75533 TRIP12-202ENST00000343290 583 ntTSL 320.65■□□□□ 0.91e-6■■■■■ 245
SF3B1O75533 TRIP12-208ENST00000430954 719 ntTSL 213.62□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 245
SF3B1O75533 TRIP12-207ENST00000428959 584 ntTSL 38.96□□□□□ -0.981e-6■■■■■ 245
SF3B1O75533 TRIP12-209ENST00000435716 603 ntTSL 38.87□□□□□ -0.991e-6■■■■■ 245
SF3B1O75533 GOT1-201ENST00000370508 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.567e-8■■■■■ 243.5
SF3B1O75533 POLR3G-202ENST00000503373 763 ntTSL 413.08□□□□□ -0.323e-6■■■■■ 242.4
SF3B1O75533 POLR3G-201ENST00000399107 3285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.673e-6■■■■■ 242.4
SF3B1O75533 POLR3G-204ENST00000504930 3251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.823e-6■■■■■ 242.4
SF3B1O75533 LZTS2-205ENST00000454422 804 ntTSL 234.14■■■■□ 3.068e-7■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 WSB2-205ENST00000536738 824 ntTSL 331.2■■■□□ 2.581e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 TXNL4A-207ENST00000586825 586 ntTSL 329.16■■■□□ 2.261e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 TXNL4A-205ENST00000586295 706 ntTSL 328.72■■■□□ 2.191e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.191e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.161e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 MYO18A-224ENST00000636100 1564 ntTSL 528.33■■■□□ 2.131e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 INTS6-205ENST00000461515 602 ntTSL 227.42■■□□□ 1.981e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 PAXBP1-206ENST00000464256 1692 ntTSL 1 (best)27.41■■□□□ 1.981e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.971e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.941e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.91e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.811e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 INTS6-213ENST00000486195 555 ntTSL 426.32■■□□□ 1.81e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.771e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 ZNF639-207ENST00000491818 1228 ntTSL 525.78■■□□□ 1.721e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 SAC3D1-204ENST00000530213 1563 ntTSL 1 (best)25.12■■□□□ 1.611e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.611e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.571e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.551e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 PACRGL-232ENST00000514663 573 ntTSL 424.57■■□□□ 1.521e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 PACRGL-204ENST00000467997 1373 ntTSL 524.3■■□□□ 1.481e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 PACRGL-233ENST00000515339 543 ntTSL 424.25■■□□□ 1.471e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 PACRGL-216ENST00000506745 681 ntTSL 524.25■■□□□ 1.471e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 PACRGL-221ENST00000509469 580 ntTSL 424.25■■□□□ 1.471e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 PACRGL-220ENST00000508952 987 ntTSL 1 (best)24.25■■□□□ 1.471e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 PTPN2-215ENST00000592776 772 ntTSL 524.15■■□□□ 1.461e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 PACRGL-217ENST00000506951 936 ntTSL 1 (best)24.11■■□□□ 1.451e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.451e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 PAXBP1-208ENST00000472588 1410 ntTSL 1 (best)23.8■■□□□ 1.41e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 SAC3D1-202ENST00000528109 1518 ntTSL 1 (best)23.74■■□□□ 1.391e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.381e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.361e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 TXNL4A-204ENST00000585769 988 ntTSL 223.23■■□□□ 1.311e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 PACRGL-231ENST00000514485 860 ntTSL 323.11■■□□□ 1.291e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 PACRGL-225ENST00000511089 647 ntTSL 523.09■■□□□ 1.291e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 GYG2-208ENST00000520904 624 ntTSL 323.07■■□□□ 1.285e-8■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.281e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 ABHD16A-216ENST00000498420 1137 ntTSL 522.99■■□□□ 1.271e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.251e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 SLC39A4-204ENST00000527148 684 ntTSL 222.81■■□□□ 1.242e-6■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 TXNL4A-202ENST00000355491 803 ntTSL 1 (best)22.75■■□□□ 1.231e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.221e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.221e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 PACRGL-229ENST00000513861 564 ntTSL 422.67■■□□□ 1.221e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.21e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 PACRGL-226ENST00000511160 556 ntTSL 422.37■■□□□ 1.171e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.161e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 CEP131-207ENST00000573053 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 522.27■■□□□ 1.161e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 GPAA1-211ENST00000529503 878 ntTSL 522.27■■□□□ 1.161e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 GPAA1-207ENST00000526341 557 ntTSL 522.27■■□□□ 1.161e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.151e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.151e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 WDR41-205ENST00000505129 1042 ntTSL 222.21■■□□□ 1.152e-20■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.141e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 SAC3D1-203ENST00000529996 1366 ntTSL 222.13■■□□□ 1.131e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 GPAA1-210ENST00000528073 986 ntTSL 322.06■■□□□ 1.121e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 DHRS2-203ENST00000432832 834 ntTSL 222.05■■□□□ 1.121e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 GPAA1-213ENST00000530258 535 ntTSL 421.87■■□□□ 1.091e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 DHRS2-205ENST00000553896 1352 ntTSL 1 (best)21.86■■□□□ 1.091e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.091e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.071e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 MYO18A-218ENST00000546105 1442 ntTSL 221.7■■□□□ 1.061e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 GPAA1-204ENST00000525087 937 ntTSL 521.64■■□□□ 1.051e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 GPAA1-217ENST00000532758 1079 ntTSL 321.64■■□□□ 1.051e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 GPAA1-214ENST00000530633 835 ntTSL 321.6■■□□□ 1.051e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.041e-10■■■■■ 241.2
SF3B1O75533 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.031e-10■■■■■ 241.2
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 3402.6 ms