Protein–RNA interactions for Protein: O75128

COBL, Protein cordon-bleu, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLO75128 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
COBLO75128 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
COBLO75128 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
COBLO75128 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
COBLO75128 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
COBLO75128 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
COBLO75128 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
COBLO75128 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
COBLO75128 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
COBLO75128 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
COBLO75128 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
COBLO75128 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
COBLO75128 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
COBLO75128 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
COBLO75128 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
COBLO75128 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
COBLO75128 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
COBLO75128 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
COBLO75128 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
COBLO75128 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
COBLO75128 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
COBLO75128 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
COBLO75128 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
COBLO75128 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
COBLO75128 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
COBLO75128 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
COBLO75128 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
COBLO75128 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
COBLO75128 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
COBLO75128 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
COBLO75128 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
COBLO75128 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
COBLO75128 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
COBLO75128 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
COBLO75128 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
COBLO75128 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
COBLO75128 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
COBLO75128 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
COBLO75128 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
COBLO75128 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
COBLO75128 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
COBLO75128 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
COBLO75128 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
COBLO75128 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
COBLO75128 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
COBLO75128 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
COBLO75128 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
COBLO75128 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
COBLO75128 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
COBLO75128 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
COBLO75128 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
COBLO75128 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
COBLO75128 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
COBLO75128 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
COBLO75128 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
COBLO75128 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
COBLO75128 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
COBLO75128 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
COBLO75128 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
COBLO75128 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
COBLO75128 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
COBLO75128 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
COBLO75128 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
COBLO75128 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
COBLO75128 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
COBLO75128 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
COBLO75128 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
COBLO75128 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
COBLO75128 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
COBLO75128 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
COBLO75128 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
COBLO75128 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
COBLO75128 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
COBLO75128 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
COBLO75128 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
COBLO75128 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
COBLO75128 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
COBLO75128 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
COBLO75128 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
COBLO75128 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
COBLO75128 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
COBLO75128 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
COBLO75128 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
COBLO75128 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
COBLO75128 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
COBLO75128 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
COBLO75128 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
COBLO75128 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
COBLO75128 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
COBLO75128 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
COBLO75128 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
COBLO75128 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
COBLO75128 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
COBLO75128 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
COBLO75128 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
COBLO75128 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
COBLO75128 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
COBLO75128 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
COBLO75128 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
COBLO75128 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms