Protein–RNA interactions for Protein: O75030

MITF, Microphthalmia-associated transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITFO75030 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MITFO75030 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MITFO75030 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MITFO75030 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MITFO75030 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MITFO75030 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MITFO75030 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MITFO75030 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MITFO75030 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MITFO75030 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MITFO75030 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MITFO75030 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MITFO75030 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MITFO75030 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MITFO75030 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MITFO75030 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MITFO75030 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MITFO75030 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MITFO75030 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MITFO75030 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MITFO75030 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MITFO75030 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MITFO75030 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MITFO75030 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MITFO75030 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MITFO75030 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MITFO75030 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MITFO75030 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MITFO75030 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MITFO75030 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MITFO75030 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MITFO75030 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MITFO75030 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MITFO75030 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MITFO75030 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MITFO75030 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MITFO75030 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MITFO75030 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MITFO75030 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MITFO75030 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MITFO75030 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MITFO75030 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MITFO75030 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MITFO75030 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MITFO75030 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MITFO75030 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MITFO75030 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MITFO75030 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MITFO75030 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MITFO75030 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MITFO75030 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MITFO75030 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MITFO75030 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MITFO75030 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MITFO75030 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MITFO75030 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MITFO75030 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MITFO75030 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MITFO75030 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MITFO75030 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MITFO75030 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MITFO75030 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MITFO75030 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MITFO75030 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MITFO75030 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MITFO75030 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MITFO75030 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MITFO75030 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MITFO75030 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MITFO75030 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MITFO75030 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MITFO75030 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MITFO75030 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MITFO75030 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MITFO75030 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MITFO75030 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MITFO75030 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MITFO75030 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MITFO75030 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MITFO75030 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MITFO75030 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MITFO75030 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MITFO75030 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MITFO75030 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MITFO75030 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MITFO75030 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MITFO75030 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MITFO75030 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MITFO75030 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MITFO75030 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MITFO75030 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MITFO75030 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MITFO75030 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MITFO75030 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MITFO75030 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MITFO75030 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MITFO75030 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MITFO75030 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MITFO75030 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MITFO75030 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms