Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF10O60809 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF10O60809 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF10O60809 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF10O60809 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF10O60809 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF10O60809 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF10O60809 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF10O60809 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF10O60809 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF10O60809 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF10O60809 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF10O60809 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF10O60809 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF10O60809 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF10O60809 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF10O60809 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF10O60809 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF10O60809 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF10O60809 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF10O60809 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF10O60809 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF10O60809 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF10O60809 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF10O60809 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF10O60809 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF10O60809 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF10O60809 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF10O60809 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF10O60809 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF10O60809 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF10O60809 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAMEF10O60809 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF10O60809 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF10O60809 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF10O60809 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF10O60809 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF10O60809 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF10O60809 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF10O60809 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF10O60809 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF10O60809 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF10O60809 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF10O60809 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF10O60809 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF10O60809 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF10O60809 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF10O60809 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF10O60809 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEF10O60809 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEF10O60809 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEF10O60809 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEF10O60809 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PRAMEF10O60809 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRAMEF10O60809 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PRAMEF10O60809 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRAMEF10O60809 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF10O60809 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF10O60809 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF10O60809 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF10O60809 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF10O60809 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF10O60809 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF10O60809 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF10O60809 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF10O60809 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF10O60809 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF10O60809 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF10O60809 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF10O60809 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF10O60809 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF10O60809 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF10O60809 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF10O60809 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF10O60809 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF10O60809 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF10O60809 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF10O60809 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF10O60809 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF10O60809 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF10O60809 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF10O60809 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF10O60809 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF10O60809 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF10O60809 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF10O60809 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF10O60809 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF10O60809 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF10O60809 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF10O60809 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF10O60809 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF10O60809 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF10O60809 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF10O60809 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF10O60809 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF10O60809 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF10O60809 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF10O60809 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF10O60809 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF10O60809 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
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