Protein–RNA interactions for Protein: O60749

SNX2, Sorting nexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX2O60749 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNX2O60749 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX2O60749 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX2O60749 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX2O60749 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX2O60749 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX2O60749 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX2O60749 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX2O60749 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX2O60749 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX2O60749 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX2O60749 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX2O60749 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX2O60749 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX2O60749 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX2O60749 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX2O60749 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX2O60749 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX2O60749 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX2O60749 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX2O60749 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX2O60749 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX2O60749 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX2O60749 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX2O60749 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX2O60749 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX2O60749 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX2O60749 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX2O60749 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX2O60749 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX2O60749 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX2O60749 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX2O60749 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX2O60749 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX2O60749 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX2O60749 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX2O60749 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX2O60749 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX2O60749 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX2O60749 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX2O60749 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX2O60749 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX2O60749 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX2O60749 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX2O60749 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX2O60749 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX2O60749 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX2O60749 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX2O60749 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX2O60749 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX2O60749 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX2O60749 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX2O60749 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX2O60749 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX2O60749 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX2O60749 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX2O60749 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX2O60749 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX2O60749 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX2O60749 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX2O60749 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX2O60749 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX2O60749 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX2O60749 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX2O60749 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX2O60749 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX2O60749 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX2O60749 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX2O60749 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX2O60749 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX2O60749 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX2O60749 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX2O60749 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX2O60749 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX2O60749 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX2O60749 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX2O60749 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX2O60749 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX2O60749 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX2O60749 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX2O60749 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX2O60749 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX2O60749 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX2O60749 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX2O60749 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX2O60749 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX2O60749 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX2O60749 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX2O60749 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX2O60749 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX2O60749 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX2O60749 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX2O60749 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX2O60749 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX2O60749 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX2O60749 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX2O60749 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX2O60749 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX2O60749 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX2O60749 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms