Protein–RNA interactions for Protein: O60687

SRPX2, Sushi repeat-containing protein SRPX2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPX2O60687 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRPX2O60687 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRPX2O60687 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRPX2O60687 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRPX2O60687 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRPX2O60687 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRPX2O60687 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRPX2O60687 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRPX2O60687 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRPX2O60687 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRPX2O60687 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRPX2O60687 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRPX2O60687 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRPX2O60687 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRPX2O60687 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRPX2O60687 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRPX2O60687 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRPX2O60687 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRPX2O60687 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRPX2O60687 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRPX2O60687 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRPX2O60687 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRPX2O60687 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRPX2O60687 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRPX2O60687 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRPX2O60687 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRPX2O60687 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRPX2O60687 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRPX2O60687 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRPX2O60687 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRPX2O60687 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRPX2O60687 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRPX2O60687 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRPX2O60687 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRPX2O60687 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRPX2O60687 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRPX2O60687 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRPX2O60687 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRPX2O60687 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRPX2O60687 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRPX2O60687 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPX2O60687 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPX2O60687 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPX2O60687 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPX2O60687 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPX2O60687 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPX2O60687 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPX2O60687 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPX2O60687 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPX2O60687 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPX2O60687 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPX2O60687 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPX2O60687 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRPX2O60687 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRPX2O60687 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRPX2O60687 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRPX2O60687 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SRPX2O60687 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRPX2O60687 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SRPX2O60687 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRPX2O60687 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRPX2O60687 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRPX2O60687 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRPX2O60687 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRPX2O60687 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRPX2O60687 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRPX2O60687 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRPX2O60687 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRPX2O60687 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRPX2O60687 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRPX2O60687 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRPX2O60687 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRPX2O60687 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRPX2O60687 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRPX2O60687 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRPX2O60687 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRPX2O60687 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRPX2O60687 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRPX2O60687 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRPX2O60687 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPX2O60687 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPX2O60687 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPX2O60687 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPX2O60687 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPX2O60687 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPX2O60687 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPX2O60687 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRPX2O60687 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRPX2O60687 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRPX2O60687 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SRPX2O60687 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRPX2O60687 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRPX2O60687 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRPX2O60687 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRPX2O60687 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRPX2O60687 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SRPX2O60687 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRPX2O60687 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRPX2O60687 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRPX2O60687 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms